北京時(shí)間2025年2月21日凌晨,國際頂級期刊Science(《科學(xué)》)雜志發(fā)表了華中農業(yè)大學(xué)韓文元教授團隊牽頭完成的題為“Base-modified nucleotides mediate immune signaling in bacteria”的研究成果。該團隊發(fā)現了一種以堿基修飾核苷酸為第二信使的細菌抗噬菌體免疫信號通路,稱(chēng)之為“孔明系統”(Kongming),該機制通過(guò)“借用”噬菌體自身成分激活免疫反應,為理解微生物與病毒間的生存博弈開(kāi)辟了新視角。
“草船借箭”式的防御智慧
在微觀(guān)世界里,細菌與病毒之間每天都在上演著(zhù)攻防大戰。就像古代戰場(chǎng)上的謀略家,細菌進(jìn)化出了多種防御手段。研究團隊通過(guò)基因分析,發(fā)現了細菌擁有三個(gè)關(guān)鍵蛋白質(zhì),即腺苷脫氨酶(KomA)、HAM1樣非典型嘌呤NTP焦磷酸酶(KomB)和含SIR2樣結構域的蛋白(KomC),它們組成了一套防御體系。當病毒入侵時(shí),其攜帶的脫氧核苷酸激酶(DNK)意外成為激活這套系統的“開(kāi)關(guān)”。
“‘孔明系統’的孔明A(KomA)相當于是一個(gè)傳令兵,在噬菌體的一個(gè)酶(DNK)的幫助下產(chǎn)生信號分子(dITP),孔明B(KomB)和C(KomC)就相當于是戰士,接受到了信號,開(kāi)始消耗細胞內的能量分子,消耗之后,細菌就會(huì )死掉,病毒它也不能夠生存!比A中農業(yè)大學(xué)韓文元教授表示。
韓文元教授通過(guò)古代戰場(chǎng)的比喻告訴我們其中奧秘,盡管被入侵的細菌死了,但周?chē)募毦鷧s得到了保護,這是自我犧牲的防御機制。他表示最精妙的是,整個(gè)過(guò)程完全借用了病毒自身攜帶的“工具包”,就像三國時(shí)期諸葛亮巧用草船獲得敵軍箭矢的智謀,因此得名“孔明系統”。
面對細菌的“絕地反擊”,噬菌體也進(jìn)化出對抗策略。以T5噬菌體為例,其分泌的Dmp酶可精準降解“孔明系統”的啟動(dòng)原料dAMP,使免疫信號無(wú)法傳遞。這種“矛與盾”的較量揭示了微生物世界生存競爭的全新維度——核苷酸代謝戰。
免疫信號傳遞領(lǐng)域的重大突破
生物體內的信號傳遞如同精密的通信網(wǎng)絡(luò ),而核苷酸分子長(cháng)期被認為是關(guān)鍵的“信號兵”。自1950年代發(fā)現環(huán)狀核苷酸(如cAMP、cGMP)以來(lái),科學(xué)家已解析了其在代謝調節、免疫應答中的核心作用,相關(guān)研究多次獲得諾貝爾獎。近年研究更發(fā)現,細菌利用環(huán)狀核苷酸抵御噬菌體(感染細菌的病毒)的機制與人類(lèi)免疫系統存在進(jìn)化關(guān)聯(lián)。
本研究發(fā)現的“孔明系統”,通過(guò)獨特的堿基修飾合成非典型核苷酸(non-canonical nucleotides)作為第二信使,突破了這一經(jīng)典理論體系。
突破局限前景可期
這項發(fā)現不僅讓人類(lèi)更深入了解微生物的生存智慧,更具有重要應用前景?茖W(xué)家發(fā)現,這種防御系統廣泛存在于多種細菌中,其模塊化結構(核心KomB-KomC搭配可變KomA)提示自然界可能存在更多未知的核苷酸信號系統。
“核苷酸它會(huì )被孔明B(KomB)和孔明C(KomC)結合,會(huì )觸發(fā)一種反應,我們可以通過(guò)控制反應讓它去產(chǎn)生熒光,在這種情況下熒光強度就能夠對應核苷酸的量!比A中農業(yè)大學(xué)韓文元教授表示。
其特異性識別dITP的特性更具備醫學(xué)應用潛力:未來(lái)或可開(kāi)發(fā)便攜式核苷酸檢測工具,助力遺傳代謝。ㄈ鏏DA缺乏癥)診斷及抗癌藥物療效監測,突破現有檢測技術(shù)依賴(lài)大型儀器的局限。
來(lái)源:長(cháng)江云新聞
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