研究揭示魚(yú)類(lèi)腸道菌群主要門(mén)類(lèi)的功能特征

  近日，中國農業(yè)科學(xué)院飼料研究所水產(chǎn)微生物與飼料創(chuàng )新團隊構建了首個(gè)草魚(yú)腸道微生物基因目錄，并解析了草魚(yú)腸道微生物組的主要互作模式和功能特征，為魚(yú)類(lèi)腸道菌群調控提供了理論基礎。相關(guān)研究成果發(fā)表在《微生物組（Microbiome）》上。

  共生微生物可調節養殖魚(yú)類(lèi)的生長(cháng)和健康性狀，目前對魚(yú)類(lèi)腸道微生物基因組的了解較少。該研究利用宏基因組學(xué)技術(shù)，構建了草魚(yú)腸道微生物的非冗余基因目錄(57.6萬(wàn)個(gè)基因)，并對基因目錄進(jìn)行了系統的分類(lèi)和功能注釋。

  該項研究發(fā)現，草魚(yú)腸道微生物存在兩個(gè)功能群，二者在生態(tài)學(xué)上表現為互斥模式，并在與宿主互作方面存在顯著(zhù)差異。進(jìn)一步研究發(fā)現，兩個(gè)功能群在碳水化合物利用、毒力因子和抗生素耐藥性基因方面均表現出顯著(zhù)的遺傳能力差異；功能群2與功能群1的比值能夠有效反映不同飲食下草魚(yú)的腸道微生物群結構及功能特征，該比值可作為評估魚(yú)類(lèi)腸道菌群穩態(tài)的指標。