肺癌的發(fā)生發(fā)展或與真菌相關(guān)！交大醫學(xué)院多團隊合作發(fā)布重磅成果

  國際頂尖腫瘤學(xué)期刊《癌細胞》（Cancer Cell，影響因子50.3）在線(xiàn)發(fā)表了上海交通大學(xué)醫學(xué)院公共衛生學(xué)院/單細胞組學(xué)與疾病研究中心/腫瘤系統醫學(xué)全國重點(diǎn)實(shí)驗室王慧/劉寧寧聯(lián)合團隊成果。該研究首次闡明真菌促進(jìn)肺癌發(fā)展的分子機制，引發(fā)業(yè)界廣泛關(guān)注。

  聯(lián)合團隊從腫瘤組織內分離并鑒定出一株促進(jìn)肺癌發(fā)展的真菌菌株——聚多曲霉，通過(guò)整合深度宏基因組學(xué)、培養組學(xué)、基因組學(xué)、轉錄組學(xué)等多組學(xué)技術(shù)，解析了肺腺癌患者不同組織部位內的真菌微生物組的種類(lèi)與分布特征，闡明瘤內真菌聚多曲霉通過(guò)與宿主之間的相互作用，誘導腫瘤免疫抑制的微環(huán)境，最終促進(jìn)肺癌發(fā)展的機制，同時(shí)證實(shí)聚多曲霉在腫瘤內的富集與肺癌患者的較差預后密切相關(guān)。

  該研究具有重大的公共衛生、疾病篩查和肺癌精準治療意義。在公眾健康領(lǐng)域，該發(fā)現為肺癌的早篩提供了新型真菌標志物；在疾病治療領(lǐng)域，在菌株水平精準靶向真菌可以促進(jìn)免疫殺傷，從而抑制肺癌的惡化進(jìn)展，該項研究成果將極大推動(dòng)基于靶向真菌的肺癌個(gè)體化靶向—免疫治療新策略，填補真菌和肺癌分子機制研究方面的空白。

  近年來(lái)，“多形態(tài)微生物組”被列為癌癥的新標志物，促進(jìn)了人類(lèi)對癌癥認知的重大突破。腫瘤內微生物組是腫瘤微環(huán)境的重要組成部分，其與宿主的相互作用對癌癥的發(fā)生、發(fā)展至關(guān)重要，因此腫瘤內微生物研究為癌癥的診斷、篩查和治療提供了嶄新的視角。然而，人們對瘤內微生物組的異質(zhì)性、潛在來(lái)源和富集，以及癌癥惡化等關(guān)鍵問(wèn)題了解甚微。探討腫瘤內四界微生物組在癌癥的發(fā)病和藥物治療過(guò)程中的分子生物學(xué)機制和健康價(jià)值，將為制定中國人群癌癥的精準篩查與防治策略提供重要的理論基礎。

  前期，該聯(lián)合團隊在本領(lǐng)域已經(jīng)積累了豐富的研究基礎和系列成果：第一，自主研發(fā)了單細胞微生物組、單細胞蛋白質(zhì)組和瘤內四界菌群時(shí)空轉錄組分析等核心技術(shù)，突破了傳統微生物組與宿主交互作用研究的技術(shù)瓶頸，整合營(yíng)養流行病學(xué)、宏基因組、蛋白質(zhì)組、代謝組、單細胞組學(xué)、人群元數據和臨床數據等多維度多模態(tài)數據信息，構建出膳食營(yíng)養—瘤內四界微生物組（細菌、真菌、古菌、病毒）-代謝物-蛋白質(zhì)-免疫狀態(tài)-健康效應之間的關(guān)聯(lián)和時(shí)空演化規律圖譜；第二，建立了樣本采集、保存和運輸、微生物組DNA富集和提取、測序和分析、培養組學(xué)分離活菌、分子、細胞和動(dòng)物實(shí)驗驗證等一整套真菌微生物組研究的標準操作規程（SOP），目前已經(jīng)在科技部國家重點(diǎn)研發(fā)計劃項目的資助下，在全國多家醫院投入使用，同時(shí)正在與世界衛生組織（WHO）合作推動(dòng)該SOP的國際化認證；在真菌與宿主相互作用分子機制研究方面，取得了系列重要研究成果；第三，依托交大醫學(xué)院?jiǎn)渭毎�組學(xué)與疾病研究中心，前期研制多項單細胞前沿研究技術(shù)和瘤內四界菌群分析研究方法，建成規模最大、覆蓋最廣、數據最全的基于宏基因組測序的結直腸癌患者腸道四界微生物組及互作網(wǎng)絡(luò )數據庫。

  本研究以上海交通大學(xué)醫學(xué)院公共衛生學(xué)院為第一作者和通訊作者單位，同濟大學(xué)附屬上海市肺科醫院與中科院上海免疫與感染研究所為共同第一作者和共同通訊作者單位。劉寧寧研究員為第一作者兼共同通訊作者，同濟大學(xué)醫學(xué)院易呈祥博士以及上海交通大學(xué)醫學(xué)院公共衛生學(xué)院衛璐琦博士為共同第一作者，通訊作者為王慧教授、劉寧寧研究員、張鵬教授和陳昌斌研究員。該研究得到了上海交通大學(xué)醫學(xué)院?jiǎn)渭毎�組學(xué)與疾病研究中心Christopher Heeschen教授和鄭小琪教授、上海交通大學(xué)醫學(xué)院附屬第一人民醫院鐘林教授、中國科學(xué)院分子細胞科學(xué)卓越創(chuàng )新中心季紅斌教授和楊巍維教授、南昌大學(xué)第一附屬醫院黃孝天和曾令兵教授、世界衛生組織國際癌癥研究署主任Zisis Kozlakidis教授、清華大學(xué)林欣教授、南京師范大學(xué)陸玲教授、上海市免疫學(xué)研究所劉智多研究員、上海市腫瘤研究所覃文新教授的大力支持和幫助，同時(shí)得到了科技部國家重點(diǎn)研發(fā)計劃、國家自然科學(xué)基金委、上海市科委、上海市教委、上海高水平地方高校創(chuàng )新團隊等項目資助。

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