“微生物組大數據搜索引擎”入選“2016年中國醫藥生物技術(shù)十大進(jìn)展”
錄入時(shí)間:2017-10-20 10:25:17
目前，中科院青島生物能源與過(guò)程研究所研發(fā)的“微生物組大數據搜索引擎”（Microbiome Search Engine; MSE）入選“2016年中國醫藥生物技術(shù)十大進(jìn)展”。
微生物組（又稱(chēng)“菌群”）在人體中與生俱來(lái)，與人體健康息息相關(guān)。因此，對海量微生物組“大數據”的搜索與挖掘，有助于認識微生物組與疾病或生態(tài)災害的關(guān)系，從而服務(wù)于生態(tài)系統的精準健康、精準護理與精準營(yíng)養。
MSE首先建立了針對元基因組數據的超高速比對算法和數字索引機制，通過(guò)機器學(xué)習等手段,自動(dòng)建立基于菌群的疾病與生態(tài)災害的診斷與預測模型,從而計算“微生物組診斷與預警指數”，以判別菌群針對特定疾病的狀態(tài)和風(fēng)險。青島生物能源所通過(guò)國際科技合作，借助MSE在世界上率先建立了基于人體共生菌群的口腔健康風(fēng)險評估體系。目前正通過(guò)全國和國際范圍內的口腔菌群大數據分析，系統考察人種、年齡、地域、生活習慣等因素對于這一健康風(fēng)險評估體系的影響。MSE正通過(guò)“生物高通量檢測分析”項目，支撐著(zhù)寶潔公司等近十個(gè)世界五百強企業(yè)和國家重點(diǎn)實(shí)驗室針對腸道、口腔、皮膚、海洋、土壤等生態(tài)系統的精準診斷、個(gè)體化護理與生態(tài)修復。MSE正成為“微生物組數據科學(xué)”的一個(gè)使能工具，服務(wù)于國內外同行針對已知微生物組數據空間的全局性思考與系統性挖掘。
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