我國微生物大數據平臺建設獲進(jìn)展

　　微生物作為最簡(jiǎn)單的生命體成為生命科學(xué)研究不可替代的基本材料，微生物數據是微生物資源共享和開(kāi)發(fā)的關(guān)鍵環(huán)節，數據資源的豐富性、準確性和共享水平?jīng)Q定著(zhù)整個(gè)微生物學(xué)領(lǐng)域研究和應用的綜合能力。世界微生物數據中心（World data center for microorganisms, WDCM）隸屬于國際生命科學(xué)聯(lián)盟（IUBS）下屬的世界微生物菌種保藏聯(lián)合會(huì )(WFCC)和聯(lián)合國教科文組織（UNESCO）下屬的國際微生物資源中心（MIRCEN），由世界菌種保藏聯(lián)盟在上世紀60年代建立，是全球微生物領(lǐng)域最重要的實(shí)物資源數據平臺，也是我國生命科學(xué)領(lǐng)域唯一的一個(gè)世界數據中心。

　　在該研究中，團隊以世界微生物數據中心為平臺倡導全球微生物菌種保藏目錄（Global Catalogue of Microorganisms，GCM）重大微生物數據資源國際合作計劃，為分散于全球各個(gè)保藏中心和科學(xué)家手中寶貴的微生物資源提供一個(gè)全球統一的數據倉庫，并以統一數據門(mén)戶(hù)的形式，對全世界科技界和產(chǎn)業(yè)界提供微生物菌種資源的信息服務(wù)。目前已經(jīng)有來(lái)自美國、法國、德國、荷蘭等43個(gè)國家和地區的107個(gè)國際微生物資源保藏機構正式參加這一計劃。

　　在大數據整合技術(shù)研究方面，團隊開(kāi)發(fā)了生物資源引用平臺系統，利用先進(jìn)的數據挖掘手段，從全球超過(guò)600萬(wàn)已發(fā)表的微生物文獻、專(zhuān)利、核酸序列和基因組中，進(jìn)一步提取了微生物資源的后續研究和利用的信息，并開(kāi)發(fā)了參考菌株目錄，作為一個(gè)跨平臺參考目錄，整合ISO以及其他國際標準菌種統一編號，推動(dòng)了全球菌種資源的高標準應用。該數據平臺對于微生物實(shí)物資源從采集、保藏、跨國轉移、學(xué)術(shù)和商業(yè)應用以及利益分享的各個(gè)環(huán)節都能提供有效的數據支持，為《名古屋議定書(shū)》在微生物領(lǐng)域的實(shí)施和執行提供最重要的支撐。平臺及其相關(guān)的指導原則，是國際上第一次形成一套完善的可運行的信息平臺方案。WDCM在CBD/NP實(shí)施方面的相關(guān)工作，也符合我國參與CBD工作的主要方向。

　　微生物大數據平臺目前已經(jīng)處于穩定的運行和服務(wù)階段，在數據集成和服務(wù)機制上，也進(jìn)行了積極的探索，使得該平臺能夠有效地在全球范圍進(jìn)行數據資源的集成，并實(shí)現可持續發(fā)展。同時(shí)，WDCM作為一個(gè)合作平臺，使我國科學(xué)家能夠在全球的角度，組織和協(xié)調各國的相關(guān)力量，建立全球性的合作框架，也讓中國有機會(huì )逐步在微生物資源的開(kāi)發(fā)應用和數據共享方面占領(lǐng)國際微生物研究前沿和主導地位。截至目前，平臺的累計訪(fǎng)問(wèn)次數已超過(guò)20萬(wàn)次。

　　該研究得到國家“863”計劃《微生物數字化信息系統集成關(guān)鍵技術(shù)研發(fā)》、中科院信息化專(zhuān)項微生物領(lǐng)域云、中科院科技促進(jìn)發(fā)展局《世界微生物數據中心建設》等項目的支持。

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