通過(guò)寄居某人體內的微生物DNA可識別出此人的身份。
研究人員發(fā)現，通過(guò)寄居人體的微生物集成DNA，能夠特異性地識別出個(gè)人的身份，這就產(chǎn)生了個(gè)人隱私問(wèn)題。
這項發(fā)現刊登于5月11日的《美國國家科學(xué)院期刊》（Proceedings of the National Academy of Sciences）上。文章指出，在一項匿名試驗研究中，通過(guò)寄生于人體的微生物（即其微生物組），很有可能識別出個(gè)人身份，從而泄露某人的健康狀況、飲食以及種族等細節信息。無(wú)獨有偶，4月29日發(fā)表于《基因組研究》（Genome Research）的一項研究也聲稱(chēng)，在由NIH維護的公開(kāi)性微生物組DNA數據中，也含有具備潛在辨識性的人類(lèi)DNA。
當然，兩篇論文均未依據微生物組的信息披露出受試者的姓名——估計目前這么做也會(huì )很困難——但他們有提出，這種具有引導性的微生物組研究應該得到備案。
來(lái)自馬薩諸塞州波斯頓哈佛陳曾熙公共衛生學(xué)院（Harvard T. H. Chan School of Public Health）的計算生物學(xué)家Curtis Huttenhower牽頭了這項最新出爐的研究。他表示，目前，微生物組的數據管理還帶著(zhù)點(diǎn)兒西部荒原的意思。但隨著(zhù)整個(gè)領(lǐng)域的發(fā)展，人們需要切實(shí)地意識到，他們的微生物組具有高度的特異性。
其實(shí)這事并不新鮮，人類(lèi)基因組研究早就因為隱私問(wèn)題受到了數年的關(guān)注。2013年，有科學(xué)家宣布，他們能在一項國際性的千人基因組項目（1，000 Genomes project）中，確定出5位匿名受試者的姓名，這是通過(guò)參照其DNA以及宗族譜系數據庫（包含年齡、居住地和姓氏）獲知的。
近年來(lái)，微生物組對人類(lèi)的健康與行為的影響已逐漸成為研究的熱點(diǎn)。而人類(lèi)微生物組研究所得的數據往往都以公開(kāi)貯存庫作為最后的歸宿，但隨著(zhù)時(shí)間的推移，這些微生物組是否能夠永久性地識別出所屬特定的人，目前尚未清楚。
Huttenhower的團隊利用源自NIH人類(lèi)微生物組計劃（HMP）的公開(kāi)數據，搜索采自人體各個(gè)部位的樣本（包括腸道、口腔、皮膚和陰道），以將這些同時(shí)具有特定識別性和時(shí)間穩定性的微生物遺傳標記組合起來(lái)（盡管HMP無(wú)法識別出個(gè)人姓名，但分辨出樣本的捐獻先后順序（數周前或數月前）還是可能的。）。
值得一提的是，糞便樣本能提供最佳的微生物識別標志：在86%的情況下，一個(gè)人的首次樣本能與其二次樣本相關(guān)聯(lián)。而皮膚樣本能獲得精確匹配的幾率只有大約四分之一。研究者還指出，在識別個(gè)人方面，基于個(gè)體微生物菌株的DNA標記能起到最佳作用，它比那些基于微生物種類(lèi)的識別方法要好得多。
對于團隊的成果，Huttenhower總結道，這應該就是“利用微生物組數據，通過(guò)單一試驗，即可非凡性地挑戰所有問(wèn)題”。他認為，可能發(fā)生的隱私風(fēng)險漏洞恐怕在于研究方案上，比如某人參加了兩項不同的微生物組研究，若每一組都含有相異的補充信息（諸如年齡及健康狀況），那就可能出現泄露。
不過(guò)，微生物組本身就可能產(chǎn)生隱私風(fēng)險，因為它們不可避免地與人類(lèi)DNA糾纏不休。盡管NIH早已竭力思考如何去除人類(lèi)DNA的方法，以防其進(jìn)入HMP數據庫，但結果不容樂(lè )觀(guān)。據加利福尼亞州勞倫斯利弗莫爾國家實(shí)驗室（Lawrence Livermore National Laboratory）的一位計算生物學(xué)家、團隊帶頭人Jonathan Allen發(fā)現，樣本的污染問(wèn)題仍普遍存在。該團隊了解到，短串聯(lián)重復序列（short tandem repeats）一般在不同的人中會(huì )發(fā)生變化，因此在法醫學(xué)中用于DNA匹配。但這種序列若是出現在微生物組樣本中，是否能構成一個(gè)精確的DNA標記呢？Allen表示目前還無(wú)法確定，但它在公眾適用性DNA數據庫的出現率的提高增加了這種可能性�！痘蚪M研究》表示，只要NIH能從其數據庫中除去已知的人類(lèi)基因序列，那么他們就同意刊登Allen及其團隊的論文。
紐約基因組中心（New York Genome Center）的計算遺傳學(xué)家Yaniv Erlich所帶領(lǐng)的團隊正是在千人基因組研究中識別出了受試者。他表示，雖然僅基于微生物組來(lái)識別出某人的幾率很低，但研究者們應當采取適當的措施來(lái)保護個(gè)人隱私。而德克薩斯州休斯頓貝勒醫學(xué)院（Baylor College of Medicine）的生物倫理學(xué)家Amy McGuire表示，由于參加HMP的受試者都已被告知風(fēng)險存在，所以他認為，不應該會(huì )出現針對此事的非理性恐慌。
但是，反應過(guò)度卻可能會(huì )減緩人們對微生物組的了解步伐。位于馬里蘭州貝塞斯達的NIH附屬?lài)⑷祟?lèi)基因組研究所（National Human Genome Research Institute）的政策負責人Laura Rodriguez表示，只要保護措施到位，比如盡可能地將人類(lèi)DNA從HMP數據庫中去除，那么“我們將希望保持其大門(mén)開(kāi)放，畢竟它能為科學(xué)增添價(jià)值�！�
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