The scientist雜志對近期最熱門(mén)的一些基因組測序成果進(jìn)行了盤(pán)點(diǎn)，兩項中國學(xué)者的測序成果格外引人注目。生物通 www.ebiotrade.com
種屬：絲葉貍藻（Utricularia gibba）
基因組：82 million bp生物通 www.ebiotrade.com
Buffalo大學(xué)、Barcelona大學(xué)等機構的研究人員測序了絲葉貍藻的基因組序列，并將結果發(fā)表在一月份的Molecular Biology and Evolution雜志上。
絲葉貍藻的基因組包含28,500個(gè)編碼基因與挪威云杉差不多，不過(guò)云杉基因組比絲葉貍藻大250倍。研究人員發(fā)現，絲葉貍藻經(jīng)歷過(guò)三次基因組加倍，應該是通過(guò)大規模DNA刪除形成這么緊湊的基因組。在許多生物中，不少基因屬于同一個(gè)家族（按功能劃分）。但絲葉貍藻的基因大多是“單獨”的，一個(gè)基因負責一個(gè)特定的功能。生物通 www.ebiotrade.com
“絲葉貍藻經(jīng)歷了如此大的DNA刪除，留下的基因一定有相當高的優(yōu)勢，”文章的共同作者Victor Albert說(shuō)。
研究顯示，絲葉貍藻擁有一些適應水中環(huán)境的獨特基因，這些基因涉及了細胞壁的生物合成，以及葉和根的發(fā)育調控。研究人員還鑒定了賦予絲葉貍藻食肉能力的基因，這些基因編碼著(zhù)可消化肉類(lèi)的酶，有些甚至類(lèi)似于人類(lèi)的胃蛋白酶。（原文：High gene family turnover rates and gene space adaptation in the compact genome of the carnivorous plant Utricularia gibba）生物通 www.ebiotrade.com
種屬：鉤蟲(chóng)（Ancylostoma ceylanicum）
基因組：313 million bp生物通 www.ebiotrade.com
據統計，全世界有四億人受到鉤蟲(chóng)的困擾�？的螤柎髮W(xué)、麻省大學(xué)、加州大學(xué)和加州理工的研究人員測序了鉤蟲(chóng)Ancylostoma ceylanicum的基因組，并將結果發(fā)表在三月二日的Nature Genetics雜志上。A. ceylanicum基因組包含約兩萬(wàn)七千個(gè)蛋白編碼基因，另外還有一萬(wàn)個(gè)基因編碼與寄生有關(guān)的短肽。研究顯示，至少有一個(gè)基因來(lái)自于細菌水平基因轉移。
A. ceylanicum既能感染人也能感染其他動(dòng)物。研究人員在倉鼠中研究了鉤蟲(chóng)致病的不同階段，通過(guò)基因表達數據鑒定了約九百個(gè)在感染初期上調的基因，這些基因編碼蛋白酶、核酸酶以及多種分泌蛋白。研究人員還確定了13個(gè)疫苗和藥物開(kāi)發(fā)的潛在靶標。生物通 www.ebiotrade.com
除了有助于預防或治療鉤蟲(chóng)感染，A. ceylanicum基因組還可以幫助人們理解鉤蟲(chóng)對免疫系統的抑制，以及為何這種寄生蟲(chóng)與近親線(xiàn)蟲(chóng)相比體形更大壽命更長(cháng)。（原文：The genome and transcriptome of the zoonotic hookworm Ancylostoma ceylanicum identify infection-specific gene families）
種屬：西藏青蛙（Nanorana parkeri）生物通 www.ebiotrade.com
基因組：2.3 billion bp
中科院昆明動(dòng)物所、云南大學(xué)、華大基因的研究人員日前完成了首個(gè)現代蛙類(lèi)基因組測序。高山倭蛙（Nanorana parkeri）的基因組含有23,400個(gè)蛋白編碼基因，具有大量的長(cháng)末端重復序列(LTR)。該基因組序列可以為人們提供高山倭蛙適應西藏極端環(huán)境（高海拔、溫差大、紫外線(xiàn)強、氧氣稀�。┑膶氋F線(xiàn)索。生物通 www.ebiotrade.com
與之前測序的非洲爪蟾相比，這個(gè)雌性高山倭蛙的基因組多了800 million bp。這一差異主要來(lái)自于占高山倭蛙基因組48%的轉座元件。高山倭蛙基因組含有970 million bp轉座元件，其中大部分是長(cháng)末端重復序列LTR，這與富含轉座子的非洲爪蟾不同。（延伸閱讀：達爾文誕辰Nature發(fā)表重要測序成果）
研究人員發(fā)現，高山倭蛙和非洲爪蟾的分歧時(shí)間大約在2.66億年前，與之前的爬行動(dòng)物基因組研究相符。這么長(cháng)的進(jìn)化史說(shuō)明青蛙的進(jìn)化速度比其他脊椎動(dòng)物（比如鳥(niǎo)類(lèi)和哺乳類(lèi)）慢得多。生物通 www.ebiotrade.com
研究人員還發(fā)現了217個(gè)在青蛙中高度保守的基因，其中一些涉及了舌頭的發(fā)育，有助于理解這種動(dòng)物快速伸長(cháng)舌頭捕捉蒼蠅的能力。（原文：Whole-genome sequence of the Tibetan frog Nanorana parkeri and the comparative evolution of tetrapod genomes）
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