一般自然情況下，進(jìn)入宿主體內的病原菌是不多的。如果它們不能迅速繁殖成很大的數量，要想侵犯我們人體這個(gè)跟細菌相比的龐然大物是不可思議的。當病原菌侵入機體后，是否能致病，首先要看該菌能否在侵入的部位繁殖，而不同部位的條件是千差萬(wàn)別的。例如破傷風(fēng)梭菌芽胞隨塵土等進(jìn)入了普通淺表部傷口，由于這種細菌是厭氧菌，而淺表部位不是厭氧微環(huán)境，芽胞不能出芽和繁殖，就不會(huì )引發(fā)破傷風(fēng)病。奇異變形桿菌易在腎臟內生長(cháng)，是因為這種細菌能產(chǎn)生尿素酶，可以分解利用尿液中的尿素作為生長(cháng)的養料。能生動(dòng)說(shuō)明宿主不同器官對病原菌敏感性不同的例子是流產(chǎn)布魯氏菌。這種細菌容易引起牛的傳染性流產(chǎn)，和牲口接觸較多的人也會(huì )因為傳染了這種細菌而患病。當牛因為感染細菌而發(fā)生流產(chǎn)時(shí)，連接胚胎與子宮的母牛胎盤(pán)是流產(chǎn)布魯氏菌唯一存在的地方，而母牛和子牛身體都未發(fā)現這種病原菌。20世紀60年代，科學(xué)家發(fā)現流產(chǎn)布魯氏菌的正常生長(cháng)需要大量的維生素和其它微量物質(zhì)，其中一種是與蔗糖類(lèi)似的物質(zhì)赤蘚醇。赤蘚醇在動(dòng)物組織中含量甚微，但在胎盤(pán)中含量很高。因而，流產(chǎn)布魯氏菌便在胎盤(pán)而不是其它部位繁衍滋生。用給實(shí)驗動(dòng)物注射赤蘚醇的方法可以誘導出全身性布魯氏菌病，證實(shí)了科學(xué)家的推斷。這說(shuō)明，微生物之所以在特定的部位生長(cháng)并引發(fā)疾病，是因為這些部位有它們需要的養分或者沒(méi)有它們不喜歡的某些物質(zhì)。而氣性壞疽則是由于某個(gè)部位缺少它不喜歡的物質(zhì)而大量繁殖的例子。引起壞疽的梭狀芽孢桿菌在污染的水源及土壤中廣泛存在，但由于它們害怕氧氣，在有氧的條件下不能生長(cháng)，所以一般是不可怕的。然而，它產(chǎn)生的孢子在空氣中能長(cháng)期存活。當梭狀芽孢桿菌的孢子恰好進(jìn)入傷口，引起受傷組織發(fā)炎腫脹時(shí)，組織的小血管受擠壓而產(chǎn)生供血不良，造成傷口供氧不足，當傷口較深時(shí)，則缺氧更加嚴重。這些細菌會(huì )產(chǎn)生了一種對人體劇毒的物質(zhì)引起嚴重的后果。
當然，不同病原菌引起疾病的數量有很大差異，傷寒沙門(mén)氏菌和霍亂弧菌處處存在，但一個(gè)身體健康的人接觸少量并不容易發(fā)病，因為需要一次侵入數十億至數百億個(gè)細菌才會(huì )引發(fā)癥狀；而鼠疫桿菌只要7個(gè)細胞就能使某些宿主患上可怕的鼠疫。
當病原菌通過(guò)原始入侵部位直接向周?chē)鷶U散時(shí)，必定會(huì )受到機體結締組織等膠樣物質(zhì)的阻擋。但是有些細菌，例如A群鏈球菌會(huì )產(chǎn)生能分解結締組織基質(zhì)中的透明質(zhì)酸的酶—透明質(zhì)酸酶，這就使它們得以在皮下組織中迅速擴散，造成蜂窩組織炎等病變。因此，透明質(zhì)酸酶又稱(chēng)擴散因子。鏈球菌還能產(chǎn)生鏈激酶（溶纖維蛋白酶）和鏈道酶（DNA酶），它們分別能降解炎癥反應中能起“包圍”病菌作用的纖維蛋白，也能降解白細胞死亡后釋放出來(lái)的粘稠的細胞核DNA，這些酶均有利于病菌在機體內的擴散。
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