前 言
本規范由國家自然科技資源平臺建設項目提出。
本規范起草單位:中國農業(yè)科學(xué)院土壤肥料研究所、中國科學(xué)院微生物研究所、中國林業(yè)科學(xué)研究院森林保護研究所、中國藥品生物制品檢定所、中國醫學(xué)科學(xué)院醫藥生物技術(shù)研究所、中國獸醫藥品監察所、中國食品發(fā)酵工業(yè)研究院。
本規范主要起草人:田國忠、李永、樸春根、姜瑞波、顧金剛、周宇光、葉強、張月琴、陳敏、程池等。
引 言
植原體是一類(lèi)無(wú)細胞壁的原核微生物,能侵染包括農作物、林木、花卉、雜草等植物,給農、林業(yè)生產(chǎn)帶來(lái)巨大損失,近年來(lái),此類(lèi)病害在某些重要植物處于蔓延和加重的趨勢。這類(lèi)微生物尚不能在人工培養基上離體培養,其細胞結構、與寄主植物的互作等方面也有其明顯不同特點(diǎn),是基礎和應用研究的重要材料。
研究制訂植原體菌種資源描述規范,有利于有效整理和保藏全國植原體菌種資源,整合菌種信息資源,達到植原體菌種資源的高效共享和可持續利用的目的。
植原體菌種資源描述規范
1 范圍
本規范規定了植原體菌種資源描述要素和描述規范。
本規范適用于植原體菌種資源的收集、整理、保藏,以及數據庫和信息共享網(wǎng)絡(luò )系統的建立。
2 規范性引用文件
下列文件中的條款通過(guò)本規范的引用而成為本規范的條款。凡是注日期的引用文件,其隨后所有的修改單(不包括勘誤的內容)或修訂版均不適用于本規范,然而,鼓勵根據本規范達成協(xié)議的各方研究是否可使用這些文件的最新版本。凡是不注日期的引用文件,其最新版本適用于本規范。
GB 19489 實(shí)驗室 生物安全通用要求
國務(wù)院令第424號《病原微生物實(shí)驗室生物安全管理條例》
科技部自然科技資源平臺聯(lián)合管理辦公室文件《自然科技資源共性描述規范(試行)》
3 術(shù)語(yǔ)、定義
下列術(shù)語(yǔ)和定義適用于本規范。
3.1
植原體 phytoplasma
指寄生于植物韌皮部篩管和介體昆蟲(chóng)體內的、具有三層單位膜結構的無(wú)細胞壁的原核生物。一般引起植物葉片黃化和發(fā)育畸形等癥狀。
4 要求
4.1 描述要求:
描述內容應清楚、準確,力求完整。
要充分考慮該菌株的最新研究進(jìn)展;
能被微生物專(zhuān)業(yè)人員理解。
4.2 描述要素
描述要素分為2類(lèi):
M:必備要素,必須描述的要素。
O:可選要素,其描述與否視具體菌株而定。
5 描述內容
5.1 基本信息
1. 學(xué)名(M)
應指明該菌株完整的科學(xué)名稱(chēng)。
2. 中文名稱(chēng)(M)
應指明該菌株的中文名稱(chēng)(如有別名,可在括號中注明)。尚無(wú)中文譯名時(shí),填寫(xiě)“暫無(wú)”。
3. 資源歸類(lèi)編碼(M)
應指明該菌株的資源歸類(lèi)編碼,參見(jiàn)《自然科技資源共性描述規范(試行)》。
4. 菌株保藏編號(M)
應指明該菌株在專(zhuān)業(yè)保藏機構的保藏編號,保藏編號由前綴和菌株編號兩部分組成。前綴為保藏機構英文名稱(chēng)的縮寫(xiě),前綴和菌株編號之間應留空格。
5. 其它中心編號(O)
宜指明該菌株在其它菌種保藏機構的菌株保藏編號。每個(gè)其它保藏機構的編號均由“=”開(kāi)頭,如編號不止一個(gè)時(shí),中間也用“=”連接。
6. 來(lái)源歷史(M)
應指明得到該菌株的途徑。如菌株轉移經(jīng)過(guò)多個(gè)保藏機構,則保藏機構之間用一個(gè)左指向的箭頭“←”連接。
7. 分離人(M)
應指明該菌株最初分離人的姓名。
8. 分離時(shí)間(M)
應指明該菌株的分離時(shí)間。
9. 原始編號(M)
應指明該菌株最初分離編號。
10. 鑒定人(O)
宜指明該菌株的鑒定人。
11. 鑒定人所在單位(O)
宜指明該菌株的鑒定人所在單位。
12. 收藏時(shí)間(O)
宜指明保藏機構收集、保藏該菌株的時(shí)間。
13. 原產(chǎn)國或地區(M)
應指明該菌株分離基物采集地所在國家或地區的名稱(chēng)。
14. 采集地區(O)
宜指明該菌株采集地的行政區劃,詳細到縣。
15. 分離基物(O)
宜指明具體的分離基物名稱(chēng)。
16. 采集地生境(O)
宜描述該菌株分離基物具體采集地點(diǎn)的生態(tài)環(huán)境,參照《微生物菌種資源采集環(huán)境描述規范(試行)》。
17. 生物危害等級(M)
應指明該菌株的生物危害等級:Ⅰ級、Ⅱ級、Ⅲ級、Ⅳ級。
18. 培養基(M)
應指明該菌株的培養基及配方。
19. 模式菌株(M)
凡是模式菌株應予指明。
20. 分類(lèi)地位 (M)
應指明每個(gè)菌株的界、門(mén)、綱、目、科、屬、候選種(組)、亞組。
21. 菌種用途 (O)
宜指明菌株已知的主要用途及功能特性。
22. 致病對象 (O)
宜指明病原菌種的致病對象及其病害名稱(chēng)。
23. 寄主名稱(chēng) (O)
宜指明菌種寄生宿主的學(xué)名和中文名稱(chēng)。
5.2 特征特性信息
24. 菌體形態(tài)和大。O)
宜指明該菌株電鏡下的菌體大小、形狀等。
25. 植原體-植物共生體培養特征(O)
宜指明該菌株與寄主植物共生過(guò)程中的培養特征,并指出培養基和培養條件。
26. 生理生化特征(O)
宜指明該菌株對抗生素的敏感性、血清學(xué)反應等生理生化特征。
27. 16S rDNA序列(O)
宜指明該菌株16S rRNA基因的序列信息,核苷酸注冊號。
28. 核糖體蛋白基因序列(O)
宜指明該菌株核糖體蛋白基因序列信息,核苷酸注冊號。
29. DNA 堿基組成(G+C)mol% 分析(O)
宜指明該菌株DNA的G+C mol%含量。
30. 23S rDNA序列(O)
宜指明該菌株23S rRNA基因序列信息,核苷酸注冊號。
31. 16SrDNA和23SrDNA間區序列(O)
宜指明16SrDNA和23SrDNA間區(16S-23S ribosomal DNA sace region)序列信息、核苷酸注冊號。
5.3 其它信息
32. 圖像信息(O)
宜給出該菌株電鏡下的形態(tài)及植原體-植物共生體等圖象信息。
33. 文獻信息(O)
宜列出該菌株公開(kāi)發(fā)表的文獻資料。
34. 保藏方法 (M)
應指明該菌株適合長(cháng)期保藏采用的技術(shù)方法。
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