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    突變生物合成在微生物藥物領(lǐng)域的研究進(jìn)展(1)



    錄入時(shí)間:2011-10-8 9:55:57 來(lái)源:中國論文下載中心

     

     【摘要】    突變生物合成作為產(chǎn)生抗生素衍生物的重要手段,自20世紀70年代興起以來(lái),發(fā)揮了巨大作用,已開(kāi)發(fā)出許多至今在臨床上仍廣泛使用的抗生素品種。隨著(zhù)基因技術(shù)的發(fā)展,突變生物合成技術(shù)可直接對次級代謝途徑中一特定酶基因進(jìn)行改造獲得突變株,大大提高了工作效率和準確性。本文綜述了突變生物合成技術(shù)在微生物藥物領(lǐng)域的應用,特別是結合基因技術(shù)進(jìn)行突變生物合成研究的新進(jìn)展。

     

    【關(guān)鍵詞】  微生物藥物

          新疾病的產(chǎn)生和耐藥菌的出現,迫切呼喚新的生物活性物質(zhì)的開(kāi)發(fā)。人們主要從三個(gè)途徑獲得新的活性物質(zhì):①自然界;②化學(xué)合成以及化學(xué)改造;③對產(chǎn)生菌的次級代謝途徑進(jìn)行改造,使其合成途徑發(fā)生改變,以獲得新化合物,主要包括突變生物合成(muta-tional biosynthesis,MBS)和前體定向生物合成(pre-cursor directed biosynthesis,PDB)。盡管前兩種方式在新藥開(kāi)發(fā)過(guò)程中仍然占主導地位,但后者特別是MBS也為一種十分有效的途徑,且顯示出巨大的潛力。

     

        MBS是指抗生素產(chǎn)生菌經(jīng)過(guò)物理、化學(xué)等誘變因素的作用或通過(guò)基因改造,生物合成途徑中的某一位點(diǎn)發(fā)生突變,喪失合成完整抗生素分子的能力而成為阻斷突變株。在發(fā)酵培養這種阻斷突變株時(shí),添加某種天然的或化學(xué)合成的化合物——突變合成元(muta- synthon)參與生物合成并獲得新抗生素的方法和過(guò)程。廣義的MBS還包括利用生物合成途徑改變獲得原抗生素的代謝產(chǎn)物和利用阻斷突變株積累一些原始菌株所不能積累的抗生素中間體。

     

        1969年,ShierMBS方法對新霉素進(jìn)行結構改造。1975年,Nagaoka等用“idiotroph”——獨需型(特需型)來(lái)描繪那些需要加入外源前體完成新衍生物合成的突變株,并用“mutational biosynthesis”——突變生物合成來(lái)描繪這種技術(shù)。1977Rinehart將這種技術(shù)定義為“mutasysthesis”。按照Rinehart的解釋?zhuān)?/SPAN>MBS技術(shù)制備新衍生物應包括:①突變株的獲得;②突變合成元的獲得;③添加的突變合成元被細胞吸收并參與新衍生物合成。此外,后續工作還應包括新衍生物的分離和結構鑒定,以及生物活性評價(jià)。

     

        本文按結構類(lèi)別介紹MBS技術(shù)在微生物藥物領(lǐng)域的研究應用,特別是近年來(lái)結合基因技術(shù)進(jìn)行MBS研究的新進(jìn)展。

     

     1 突變生物合成在氨基糖苷類(lèi)抗生素中的應用15

     

     氨基糖苷類(lèi)抗生素是臨床上重要的抗感染藥物,但存在一定程度的腎、耳毒性。因此,對已有品種進(jìn)行改造,開(kāi)發(fā)對耐藥菌有效、腎(耳)毒性相對較小的新品種一直是新藥研究人員追尋的目標。20世紀70年代,人們利用MBS技術(shù)對氨基糖苷類(lèi)抗生素進(jìn)行改造,獲得成功,特別是涉及2-脫氧鏈霉胺(2-deoxystrepta-mine,DOS)獨需型阻斷突變株的研究。如Rosi等通過(guò)誘變獲得慶大霉素產(chǎn)生菌絳紅色小單孢菌(Micromo-nospora purpureaD-突變株后,添加鏈霉胺,生成2-羥基-慶大霉素,該化合物對含有2-腺苷腺化酶的慶大霉素耐藥菌有較強活性,毒性低,在臨床上被廣泛使用。這方面的研究Rinehart等曾進(jìn)行過(guò)總結,本文不做詳細敘述。

     

        值得提出的是,20世紀80年代趙敏等通過(guò)誘變獲得a位點(diǎn)(Fig.1)阻斷的突變株JIM-401,該突變株代謝產(chǎn)物中慶大霉素C 2b GM C2b )組分即小諾米星的產(chǎn)量大大提高,并實(shí)現工業(yè)化生產(chǎn);再以JIM-401為出發(fā)菌株,獲得c位點(diǎn)阻斷的突變株JIM-202,該突變株的代謝產(chǎn)物中慶大霉素C1a GM C 1a )的積累量大大增加(含量在85%以上),在其2-脫氧鏈霉胺1-N位引入一個(gè)乙基,經(jīng)半合成獲得新化合物1-N-乙基慶大霉素C1a etimicin,依替米星);再以JIM-202為出發(fā)菌 株,獲得b位點(diǎn)阻斷的突變株JIM121,其代謝產(chǎn)物中 西索米星(sisomicin)組分的產(chǎn)量大大增加。

     

        目前,丁酰苷菌素、卡那霉素、慶大霉素、妥布霉素、新霉素、鏈霉素等氨基糖苷類(lèi)抗生素的生物合成基因簇的研究取得了可喜的成就,這為利用MBS方法結合現代基因技術(shù)對氨基糖苷類(lèi)抗生素進(jìn)行改造提供了有利條件。

     

        2 核苷類(lèi)抗生素的MBS研究[6,7

     

        Nikkomycin是唐德鏈霉菌(Streptomyces tendaeTü901產(chǎn)生的一種核苷肽類(lèi)抗生素,與幾丁質(zhì)合成酶底物UDP-N-乙酰葡萄糖胺有類(lèi)似結構,競爭性抑制幾丁質(zhì)合成酶,干擾真菌細胞壁的合成,是一種低毒的抗真菌及殺蟲(chóng)劑。

     

        尿嘧啶和4-甲;-4-咪唑啉-2-酮是nikkomycin生物合成途徑中的兩個(gè)中間體,分別對應ZX組分。1984年,Delzer等通過(guò)誘變獲得pyr - 突變株。該突變株不能合成以尿嘧啶為中間體的nikkomycin。添加23N-雜環(huán)化合物進(jìn)行MBS研究,其中胸腺嘧啶、5-羥甲基尿嘧啶和5-氟尿嘧啶可被利用合成新的衍生物。

     

        1999年,Bormann等采用基因工程方法進(jìn)行MBS的研究,構建了L-賴(lài)氨酸-2-氨基轉移酶失活突變株S.tendae nikC,該突變株不能合成nikkomycin I,J,X,Z肽基側鏈的前體哌啶-2-羧酸,積累了nikkomycin的核苷成分。當添加吡啶甲酸時(shí),可恢復產(chǎn)生nikkomycin I,J,X,Z;添加苯甲酸,獲得BxBz組分(如Fig.2所示)。BxBzX,Z有較高的pH穩定性,Bx對白念珠菌有更高的抑菌活性。

     

        此外,Bormann等還構建了產(chǎn)nikkomycin LX L 的突變株,獲得的新衍生物也顯示出很好的抗菌活性。目前,nikkomycin產(chǎn)生菌分子生物學(xué)特性的研究已經(jīng)取得了巨大的成就,通過(guò)MBS技術(shù)并結合基因手段,相信會(huì )有更多更優(yōu)質(zhì)的產(chǎn)品出現。

     

     3 ClorobiocinMBS研究[8,9

     

        Clorobiocin、新生霉素(novobiocin)和coumer-mycin(香豆霉素)是由鏈霉菌產(chǎn)生的一類(lèi)具有抑制 DNA旋轉酶活性的抗生素,同屬于氨基香豆素家族,

     

        Fig.2  MBS of nikkomycin 能夠與細菌DNA旋轉酶B亞基緊密結合,有效抑制該酶活性,實(shí)現抗菌作用。對氨基香豆素類(lèi)抗生素的研究主要集中在clorobiocin和新生霉素,兩者的結構如Fig.3所示,包括三個(gè)部分:ring A,3-異戊烯基-4-羥基-苯甲酰(3-prenyl-4-hydroxybenzoyl,DMAHB;ring B,3-氨基-4,7-二羥基香豆素(3-amino-4,7-dihy-droxycoumarin,ADHC;ring C,諾維糖(L-noviose)。2004Galm等通過(guò)基因手段構建了clorobiocin產(chǎn)生菌異戊烯基轉移酶失活突變株——cloQ  - 。該突變株不能合成DMAHB前體。添加DMAHB類(lèi)似物(如Fig.4所示)獲得了28clorobiocin衍生物。體外活性研究發(fā)現,新衍生物對大腸埃希菌DNA旋轉酶抑制活性是新生霉素的50%200%,但即使是活性最高的衍生物,其活性?xún)H為clorobiocin50%;對枯草芽孢桿菌ATCC14893的生長(cháng)抑制活性比新生霉素和clorobiocin都低;大部分新衍生物對葡萄球菌均有效。

     

      4 糖肽類(lèi)抗生素的MBS研究

     

      活性與萬(wàn)古霉素相當,但對厭氧菌尤其是梭狀芽孢桿菌的抑制活性要高得多。因此,balhimycin具有很好的臨床價(jià)值。

     

        目前,對balhimycin等糖肽類(lèi)抗生素的結構改造研究主要集中在非蛋白組成氨基酸,如β-羥基酪氨酸(Hty)、3,5-二羥基苯基甘氨酸(Dpg)和4-羥基苯基甘氨酸(Hpg)等。

     

        2002年,Pek等第一次用MBS技術(shù)對balhimycin進(jìn)行研究(Fig.6a),刪除過(guò)氧化氫酶基因bhp的一段序列,獲得Hty合成阻斷突變株。添加Hty,修復bal-himycin生產(chǎn)能力;添加外消旋3--β-羥基酪氨酸合成了fluorobalhimycin;添加2-氟,3,5-二氟-β-羥基酪氨酸也合成了相應的fluorobalhimycins;D/L-酪氨酸以及酪氨酸酚羥基被氟取代或位置改變的類(lèi)似物,未能摻入到新衍生物的合成,說(shuō)明酚羥基的重要性;钚匝芯勘砻,所有的氟化balhimycin衍生物對枯草芽孢桿菌都有抑制活性。

     

        2004年,Weist等刪除Dpg編碼基因dpgA的一段序列,獲得Dpg合成阻斷突變株。添加Dpg,修復balhimycin生產(chǎn)能力;添加4種單、雙取代羥基、甲氧基的Dpg類(lèi)似物(Fig.6b)均獲得了新衍生物;通過(guò)添加實(shí)驗,Weist等共獲得20多種糖基化方式不同的衍生物。有趣的是,添加3-單取代-苯基甘氨酸,合成的新衍生物有一部分在7Dpg5Hpg間缺少正常balhimycinAB-環(huán)聯(lián)芳鍵。 CDA CDAcalcium-dependent antibiotic)是由天藍色鏈霉菌(Streptomyces coelicolorA3產(chǎn)生的酸性脂肽類(lèi)抗生素,其結構與達托霉素(daptomycin)類(lèi)似,分子中有許多D-氨基酸和非蛋白組成氨基酸,與免疫抑制劑環(huán)孢菌素、抗腫瘤藥物博來(lái)霉素和抗菌藥物萬(wàn)古霉素同屬于非核糖體合成肽(nonribosomal peptides)家族。CDA的結構如Fig.7所示,根據R 6 、R 9 、R10 R 11 上取代基的不同,分為CD A 1b 、CD A 2b 、CD A 3b 、CD A4b 、CD A 2a 、CD A 4a 等組分。英國曼徹斯特理工 大學(xué)(UMIST)和Sanger研究所對CDA基因簇結構研究結果顯示,82Kb的基因簇序列包含了至少40個(gè)開(kāi)放閱讀框(SCO3210-SCO3249),并利用分子手段結合現代分離檢測技術(shù)對各閱讀框的功能和CDA的生物合成途徑進(jìn)行了研究和推理。

     

        2002年,Hojati等利用分子生物學(xué)手段獲得4-羥基-苯乙醇酸合成酶基因hmaSSCO3229)被破壞的突變株,該突變株不能合成CDA分子重要的結構單元4-羥基-苯基甘氨酸(Hpg)。添加外消旋4-羥基-苯乙醇酸或4-羥基-苯乙醛酸或L-Hpg可恢復CDA的生產(chǎn)能力;添加苯乙醇酸、苯乙醛酸、苯酰甘氨酸類(lèi)似物(脫羥基或羥基被鹵元素取代),獲得了芳香側鏈4位羥基被H取代的衍生物CDA 2d 和被F取代的 R6  R 9  R10  R11 CAD1b  OH OPO3 H2  H H-H CAD 2a  OH OPO3 H2  CH 3  π-bond CAD2b  OH OPO 3 H2  CH3  H-H CAD3a  OH OH H π-bond CAD3b  OH OH H H-H CAD 4a  OH OH CH 3  π-bond CAD4b  OH OH CH3  H-H CAD2d  H OPO3 H2  CH3  H-H CAD1ta  F OPO 3 H 2  CH  3  π-bond CDA 2td  F OPO3 H 2  CH3  H-H  Fig.7  Structure of CDA analoguesCDA 2fd ;而添加4-氯苯乙醛酸以及含對氯和對甲氧基的類(lèi)似物,均未得到類(lèi)似CDA2fd 的衍生物。

     

     

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