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    在大腸桿菌中高效表達外源蛋白的策略(一)



    錄入時(shí)間:2011-9-8 16:13:05 來(lái)源:生物在線(xiàn)

    本世紀60至70年代對大腸桿菌的研究使之成為自然界中最普遍為人們所認識的生物體。大腸桿菌具有兩個(gè)顯著(zhù)特征:操作簡(jiǎn)單和能在廉價(jià)的培養基中高密度培養,它的這些特征加上十多年外源基因表達的經(jīng)驗使其在大多數科研應用中成為高效表達異源蛋白最常用的原核表達系統。盡管大腸桿菌有眾多的優(yōu)點(diǎn),但并非每一種基因都能在其中有效表達。這歸因于每種基因都有其獨特的結構、mRNA的穩定性和翻譯效率、蛋白質(zhì)折疊的難易程度、宿主細胞蛋白酶對蛋白質(zhì)的降解、外源基因和E.coli在密碼子利用上的主要差別以及蛋白質(zhì)對宿主的潛在毒性等等。但知識的大量積累還是有助于為表達方面某些特定的困難提供一般的解決方法。大腸桿菌作為表達系統的主要障礙包括:不能象真核蛋白那樣進(jìn)行翻譯后修飾、缺乏將蛋白質(zhì)有效釋放到培養基中的分泌機制和充分形成二硫鍵的能力。另一方面,許多真核蛋白在非糖基化的形式下能保留其生物學(xué)活性,因而也就可以用大腸桿菌來(lái)表達。如何實(shí)現外源基因在原核細胞中的有效表達,自60年代以來(lái),對影響外源基因在其表達體系中表達效率的各個(gè)因素作了大量實(shí)驗研究,并有多篇歸納性綜述發(fā)表[1,2,3]。國內針對外源基因在原核細胞中高效表達的關(guān)鍵因素,構建了高效表達載體[4],并在此基礎上成功表達了一系列細胞因子的基因[5,6,7]。我們在分析了國內外有關(guān)在原核系統中表達蛋白的實(shí)驗資料的基礎上,對在大腸桿菌中高效表達外源蛋白的策略所涉及的內容進(jìn)行全面的總結,以期有助于我國在這方面的研究。
     
    l          有效表達載體的構型
       
        構建表達質(zhì)粒需要多種元件,需要仔細考慮它們的組合,以保證最高水平的蛋白質(zhì)合成。E.coli表達載體的基本結構如圖1所示[8]。
     
                                     RBS
                             P            
                R        -35  -10     SD   coding sequence  TT    Tet      Ori
                                                                           
     

                   -35       -10                       Stop codon
                 TTGACA(N)17TATAAT                           UAAU
                                                              UGA
                                                              UAG
                                            Start codon                               
                        mRNA 5'  UAAGGAGG(N)8  AUG(91%)   
                     16S rRNA 3'HOAUUCCUCC      GUG(8%)
                                                 UUG(1%)
      
     啟動(dòng)子(以雜和的tac啟動(dòng)子為例)位于核糖體結合位點(diǎn)(RBS)上游10-100bp處,由調節基因(R)控制,調節基因可以是載體自身攜帶,也可以整合到宿主染色體上。E.coli的啟動(dòng)子由位于轉錄起始位點(diǎn)上游約35bp的六核苷酸序列(-35區)和一短序列隔開(kāi)的另一六核苷酸序列(-10區)組成[9,10,11]。有許多啟動(dòng)子可用于在E.coli中的基因表達,包括來(lái)源于革蘭氏陽(yáng)性菌和噬菌體的啟動(dòng)子。理想的啟動(dòng)子具有以下特性:作用強;可以嚴格調控;容易轉導入其他E.coli以便篩選大量的用于生產(chǎn)蛋白的菌株,而且對其誘導是簡(jiǎn)便和廉價(jià)的[12]。在啟動(dòng)子下游是RBS,其跨度約為54個(gè)核苷酸,兩端限定在 -35(±2)和mRNA編碼序列的+19到+22之間[13]。Shine-Dalgarno(SD)位點(diǎn)[14,15]在翻譯起始階段與16S rRNA的3'端相互作用[16]。SD與起始密碼子間的距離約為5-13bp[17],而且此區的序列在mRNA轉錄物中應避免出現二級結構,否則將會(huì )降低翻譯起始的效率[18]。在RBS的5'和3'端均為A豐富區[19]。轉錄終止子位于編碼序列的下游,作為轉錄終止的信號[20]和組成發(fā)卡結構的保護性元件,阻止核酸外切酶對mRNA的降解,從而延長(cháng)mRNA的半衰期[21]。
    除了上述對基因表達的效率有直接影響的元件以外,載體還含有抗生素抗性基因,以方便質(zhì)粒的篩選和傳代。氨芐青霉素是最常用的抗性標記。但在生產(chǎn)人用治療性蛋白時(shí),最好選擇其他抗性標記(如Tet)以避免可能發(fā)生的過(guò)敏反應[22]。質(zhì)粒的拷貝數由復制起點(diǎn)決定。在特殊情況下,選用失控復制子能夠獲得大量的質(zhì)?截悢岛洼^高產(chǎn)量的質(zhì)粒編碼蛋白[23,24]。但在另外一些情況下,選用超過(guò)pBR322的高拷貝質(zhì)粒似乎并沒(méi)有好處。而且已有資料表明,增加質(zhì)粒的拷貝數降低E.coli中胰酶的產(chǎn)量,在高拷貝質(zhì)粒中,強啟動(dòng)子的存在嚴重影響了細胞的活性[25,26]。

     

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