病毒分類(lèi)系統(二)
錄入時(shí)間:2011-9-6 16:51:18
來(lái)源:生物在線(xiàn)
二、病毒分類(lèi)和命名的規則
(一)一般規則
(1)病毒分類(lèi)和命名應該是國際性的,并且普遍適用于所有的病毒。
(2)國際病毒分類(lèi)系統采用目(order)、科(family)、亞科(subfamily)、屬(genus)、種(species)、分類(lèi)階元。
(3)ICTV不負責病毒種以下的分類(lèi)和命名,病毒種以下的血清型、基因型、毒力株、變異株和分離株的名稱(chēng)由公認的國際專(zhuān)家小組確定。
(4)人工產(chǎn)生的病毒和實(shí)驗室構建的雜種病毒在病毒分類(lèi)上不予考慮,它們的分類(lèi)由公認的國際專(zhuān)家小組負責。
(5)分類(lèi)階元只有在病毒代表種的特性得到了充分了解和在公開(kāi)出版物上進(jìn)行過(guò)描述,以致于明確了它們的分類(lèi)地位,并使其分類(lèi)階元與其他類(lèi)似的分類(lèi)階元相區別時(shí),才能確定下來(lái)。
(6)當病毒有明確的科、而分屬未確定時(shí),這一病毒種在分類(lèi)學(xué)上稱(chēng)為該科的未確定種(unassigned species)。
(7)與規則2各分類(lèi)階元相關(guān)聯(lián),并得到ICTV批準的名稱(chēng)是唯一可以接受的。
(二)分類(lèi)階元的命名規則
(8)如果分類(lèi)階元的建議名稱(chēng)遵守ICTV公布的分類(lèi)和命名規則,并且適合于已設立的分類(lèi)階元,那么這些建議名稱(chēng)是有效名(valid names),在ICTV第六次報告中記錄已批準的國際名稱(chēng)或經(jīng)過(guò)ICTV表決批準的分類(lèi)建議名稱(chēng)是接受名(accepted names)。
(9)現有的病毒名稱(chēng)和分類(lèi)階元只要是用的,就應該保留。
(10)病毒及其分類(lèi)階元的命名不遵守優(yōu)先法則(the rule of priority)。
(11)在設計新分類(lèi)階元名稱(chēng)時(shí),不能使用人名進(jìn)行命名。
(12)分類(lèi)階元的名稱(chēng)應該是易于使用和記憶,以諧音名(euphonious name)最好。
(13)上標、下標、連字符、斜線(xiàn)和希臘字母在設計新命名時(shí)不能使用。
(14)新名稱(chēng)不應該與已批準的名稱(chēng)重復,所選擇的新名稱(chēng)也不應該與現在和過(guò)去使用的名稱(chēng)相似或相近。
(15)縮拼字(sigla)若是由幾個(gè)研究小組建議,并且這一領(lǐng)域的病毒研究者是有意義的,那么縮拼字可以接受作為分類(lèi)階元的名稱(chēng)。
(16)如果所建議的候選名(candidate name)不只一個(gè)時(shí),那么相關(guān)下屬委員會(huì )應該首先向ICTV常務(wù)委員會(huì )作出推薦,然后由ICTV常務(wù)委員會(huì )決定哪一個(gè)候選名是可以接受的。
(17)當某一分類(lèi)階元建議缺少適當的名稱(chēng)時(shí),這一分類(lèi)階元仍然可以被批準,其待定名將保留至有一個(gè)建議名稱(chēng)ICTV接受為止。
(18)由于所選用的病毒名稱(chēng)完全或部分不隱含分類(lèi)階元的任何意義,這樣就會(huì )出現下列不同的情形:① 一些病毒因名稱(chēng)或缺少描述特征而從表面上看是排斥在該分類(lèi)階元中,但它們卻是這一已命名的分類(lèi)階元成員;② 一些迄今尚未描述的病毒似乎是排斥在該分類(lèi)階元中,但它們卻可能屬于這一已命名的分類(lèi)階元;③一些病毒表面上看來(lái)是屬于這一分類(lèi)階元,但它們卻又是其他不同分類(lèi)階元的成員。
(19)新分類(lèi)階元名稱(chēng)的選用應考慮國家或地區敏感性的問(wèn)題,當一些名稱(chēng)已被病毒學(xué)工作者在公開(kāi)出版物上廣為使用時(shí),該名稱(chēng)或其派生名稱(chēng)應該是命名的優(yōu)先選擇,而不應該考慮這一名稱(chēng)源自哪一個(gè)國家。
(20)名稱(chēng)的改變、新名稱(chēng)以及分類(lèi)階元的設立和分類(lèi)階元的排列的建議應該正式提交給ICTV常務(wù)委員會(huì ),在作出決定之前,ICTV下屬委員會(huì )和研究小組應該進(jìn)行充分協(xié)商。
(三)種的規則
(21)病毒種是指構成一個(gè)復制譜系(replicating lineage),占據一個(gè)特定小生境(ecological niche),具有多原則分類(lèi)(polythetic class)特性的病毒。
(22)當ICTV下屬委員會(huì )不能肯定某一個(gè)新種的分類(lèi)地位,或不能將這一新種確定在已設定的屬中時(shí),新種會(huì )作為暫定種(tentative species)列在適當的屬或科中,按一般分類(lèi)而言,暫定種的名稱(chēng)不應該與已批準的名稱(chēng)重復,選擇不相似或不相近于現在和不久前一直使用的名稱(chēng)。
(23)種名由少數幾個(gè)有實(shí)際意義的詞組成,但不應該只是由宿主名加“virus”構成。
(24)種名必須賦予種恰如其分的鑒別特征。
(25)數字、字母或其組合已經(jīng)廣泛用作種的形容詞,然而新指定的編號、字母或其組合不再單獨作為種的形容詞,F存的數字或字母名稱(chēng)仍可以繼續保留。
(四)屬的規則
(26)屬是一群具有某些共同特性的種。
(27)屬名的詞尾是“…virus”。
(28)一個(gè)承認的新屬必須有一個(gè)同時(shí)被承認代表種(type species)。
(五)亞科的規則
(29)亞科是一群具有某些共同特性的種。這一分類(lèi)階元只在需要解決復雜分類(lèi)階元問(wèn)題時(shí)使用。
(30)亞科名的詞尾是“…virinae”。
(六)科的規則
(31)科是一群具有某些共同特征的屬(無(wú)論這些屬是否構成亞科)。
(32)科名的詞尾是“…viride”。
(七)目的規則
(33)目是一群具有某些共同特征的科。
(34)目名的詞尾是“…virales”。
(八)亞病毒感染因子的規則
(35)有關(guān)病毒分類(lèi)的規則也適用于類(lèi)病毒(viroids)分類(lèi)。
(36)類(lèi)病毒種的詞尾是“viroid”,屬的詞尾為“-viroid”,亞科的詞尾是“-viroinae”(只用于需要這一分類(lèi)階元時(shí)),科的詞尾是“-viroidae”。
(37)逆轉座子(retrotransposons)在分類(lèi)和命名中被考慮作為病毒。
(38)衛星和朊病毒不是按病毒分類(lèi),而是采用任意分類(lèi)(arbitrary classification),并且這種任意分類(lèi)對專(zhuān)門(mén)領(lǐng)域的研究工作者是有用的。
(九)書(shū)寫(xiě)規則
(39)在正式使用場(chǎng)合,病毒目、科、亞科、屬的接受名(accepted name)一律用斜體打印,名稱(chēng)的第一個(gè)字母要大寫(xiě)。
(40)種名用斜體打印,第一個(gè)詞的首字母要大寫(xiě),除了是專(zhuān)有名詞(proper noun)外,其他詞首字母一律大寫(xiě)。
(41)在正式使用場(chǎng)合,分類(lèi)階元名稱(chēng)應放在分類(lèi)階元術(shù)語(yǔ)前。
如,各分類(lèi)單元正式的描述是…Reovirideae(科),…Phytoreovirus(屬), …wound tumor virus(種)等。
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