一、基因組(genome)
細菌的基因組位于核體,是遺傳的主要物質(zhì)基礎。核體又稱(chēng)染色體(chromosome)是由環(huán)狀雙螺旋兩條DNA長(cháng)鏈組成,含細菌的遺傳基因,控制細菌的遺傳與變異。每條DNA單鏈的骨架由磷酸和脫氧核糖組成,支鏈含有四種堿基,即兩種嘌呤:腺嘌呤(A)和鳥(niǎo)嘌呤(G),兩種嘧啶:胸腺嘧啶(T)和胞嘧啶(C)。細菌染色體DNA以半保留方式進(jìn)行復制。新形成的DNA雙鏈分子與親代的完全相同,所攜帶的遺傳信息也與親代的完全相同。倘若在DNA復制中,子代DNA發(fā)生改變,便會(huì )出現變異。
二、質(zhì)粒(plasmid)
質(zhì)粒是細菌染色體外的遺傳物質(zhì),多為環(huán)狀雙螺旋DNA分子,可為一種或若干種。質(zhì)?梢宰陨韽椭,隨宿主菌分裂傳到子代菌體。質(zhì)粒是自行復制單位,有多個(gè)拷貝者,稱(chēng)為松弛型復制;有的需隨染色體一起復制,僅一個(gè)拷貝者,稱(chēng)為嚴緊型復制(stringent replication)。前者稱(chēng)為松弛型質(zhì)粒,后者稱(chēng)為嚴緊型質(zhì)粒。
質(zhì)?删幋a細菌多種重要的生物學(xué)性狀,但不為細菌生命所必需的性狀。在一定條件下,質(zhì)?梢赞D移,可丟失,也可重新獲得。編碼性菌毛的質(zhì)粒稱(chēng)致育質(zhì)粒或F質(zhì)粒(fertility plasmid),具有F質(zhì)粒的細菌有性菌毛,為雄性細菌;無(wú)F質(zhì)粒的細菌無(wú)性菌毛,為雌性細菌,該質(zhì)粒與細菌的有性結合有關(guān)。編碼細菌各種毒力因子的質(zhì)粒統稱(chēng)毒力質(zhì)粒或Vi質(zhì)粒(virulence plasmid),如致病性大腸桿菌在粘膜上定居及產(chǎn)生毒素的能力可由不同質(zhì)粒編碼,其中K質(zhì)粒編碼對粘膜具有粘附活性的菌毛,ST質(zhì)粒與LT質(zhì)粒分別編碼耐熱腸毒素和不耐熱腸毒素。細菌對抗菌藥物或重金屬鹽類(lèi)的抗性則由R質(zhì)粒(resistance plasmid)所決定。一個(gè)質(zhì)?赏瑫r(shí)具有幾種編碼功能。
質(zhì)?梢栽诩毦g轉移,當質(zhì)粒從一個(gè)細菌轉移至另一個(gè)細菌時(shí),攜帶的性狀也隨之轉移。質(zhì)粒的轉移不僅可以發(fā)生在同種、同屬的細菌之間,有的甚至還可以在不同種屬的細菌間進(jìn)行。按其轉移的特性可將質(zhì)粒分為二類(lèi):接合性質(zhì)粒(conjugative plasmid)與非接合性質(zhì)粒(nonconjugative plasmid)。接合性質(zhì)粒一般使細菌有致育性,并且在細菌之間接觸時(shí)能從一個(gè)細菌轉移到另一個(gè)細菌中去(如F質(zhì)粒)。非接合性質(zhì)粒不能在細菌之間轉移,但有的可以通過(guò)以噬菌體為載體或直接進(jìn)入另一個(gè)細菌而轉移。非接合性質(zhì)粒也可以與接合性質(zhì)粒結合隨接合性質(zhì)粒轉移。有的質(zhì)粒還可以結合到染色體上,如F質(zhì)粒在變形桿菌內是獨立存在的,但在大腸桿菌內則可與染色體結合,這種質(zhì)粒稱(chēng)為附加體(episome)。
穿梭載體(shuttle vector) 是一類(lèi)特殊的質(zhì)粒,可在某種屬關(guān)系差異較大的微生物中轉移,例如在大腸桿菌與酵母之間。利用它可攜帶質(zhì)核或真核微生物的外源序列。
三、轉座因子(transposable element)
近年來(lái)發(fā)現微生物的某些DNA片段作為一個(gè)獨立單位可在染色體上移動(dòng),此種移動(dòng)甚至可發(fā)生在不同種細胞之間。這種可移動(dòng)的DNA片段稱(chēng)之為轉座因子。細菌的轉座因子有三種類(lèi)型:插入序列(insertion sequence, IS)、轉座子(transposon, Tn)以及某些特殊的噬菌體,例如Mu,是促變噬菌體(mutator phage)的簡(jiǎn)稱(chēng)。
IS與Tn具有兩個(gè)共同特點(diǎn),一是都攜帶編碼轉座酶(transposase)的基因,二是在其DNA末端都有短的倒置末端重復子。重復子長(cháng)約40~1000 bp。IS分子量較。0.7~1.4 kb),Tn比IS大(2~2.5 kb),除轉座酶基因外,還含某些具有重要特性例如抗性標記的基因。Tn是當今遺傳學(xué)及基因工程研究的有用工具。Mu分子量約2~2.5 kb,與一般溫和噬菌體不同,它可整合到大腸桿菌染色體的任何位置,從而引起插入突變。
四、毒力島(pathogenicity island, PAI)
是20世紀90年代提出的一個(gè)新概念。PAI是指病原菌的某個(gè)或某些毒力基因群,分子結構與功能有別于細菌染色體,但位于細菌染色體之內,因此稱(chēng)之為“島”。PAI雖然是染色體的DNA片段,但兩端往往具有重復序列與插入元件,其G+Cmol%及密碼使用與細菌染色體有明顯差異,分子量較大,多為30~40 kb,也有達100 kb者。
一般認為,PAI不位于質(zhì);蚋郊芋w,基因編碼的產(chǎn)物多為分泌性蛋白或細胞表面蛋白。一種病原菌可以有一個(gè)以上的毒力島。毒力島的生物學(xué)意義尚不清楚,推測其與細菌的毒力變異有關(guān)。鑒于毒力島的結構特點(diǎn),決定了它可在細菌的不同菌株甚至不同菌種之間進(jìn)行DNA重組。有人指出,在環(huán)境中存在著(zhù)致病菌株與非致病菌株,后者通過(guò)基因重組從前者獲得了毒力島,從而具備了致病性,而不是通過(guò)自身固有基因的修飾導致的毒力變異。目前一些新致病菌的出現有可能歸咎于此。
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