1 艱難梭菌簡(jiǎn)介
艱難梭菌又叫“艱難梭狀芽孢桿菌”,最早發(fā)現于上世紀30年代,是造成醫院感染和住院病患腹瀉的常見(jiàn)細菌。普通人群中約有3%的人的腸胃中都有這種細菌,在正常情況下,該細菌受制于人體內的其他細菌,不會(huì )危害人體健康。但對于長(cháng)期或是大量服用抗生素的病人而言,這種細菌是可怕的,甚至是致命的。這是由于藥物破壞了人體腸胃中各種菌類(lèi)之間的平衡,所以容易導致“艱難梭菌”感染。就“艱難梭菌”本身而言,其致命性并不高,在0.6%到1.5%之間,但由于感染該細菌通常會(huì )伴隨偽膜性結腸炎的出現,一旦出現這種情況,死亡率就會(huì )猛增到35%到50%。而且,與所有的細菌一樣,“艱難梭菌”會(huì )通過(guò)突變產(chǎn)生新的變種,而這些變種細菌的毒性和對人體的危害性、致命性通常也更強。
2 艱難梭菌的傳統檢測方法
所有艱難梭菌菌株皆表達抗原谷氨酸脫氫酶,但是艱難梭菌分為產(chǎn)毒菌株和不產(chǎn)毒菌株兩種。僅產(chǎn)毒菌株分泌毒素A和毒素B。毒素A和毒素B都可以導致艱難梭菌相關(guān)疾病的發(fā)生。艱難梭菌的檢測主要是通過(guò)對疑似病例的糞便中毒素的檢測完成[1]。直接糞便毒素測定包括細胞毒素測定(CTA)和酶免疫測定(EIA)[2]。CTA中毒素B的檢測被認為是艱難梭菌檢測的金標準[3]。CTA涉及到將培養的細胞暴露到有或者沒(méi)有抗毒素存在的排泄抽提物中。如果排泄物樣本是艱難梭菌陽(yáng)性,則對沒(méi)有經(jīng)過(guò)抗毒處理的培養細胞有毒害作用[4]。
艱難梭菌也可以通過(guò)在厭氧條件下培養而被檢測。這種方法具有很高的靈敏度,但是也很耗費時(shí)間,需要超過(guò)三天的時(shí)間。另外,這種方法不能區分產(chǎn)毒菌株和非產(chǎn)毒菌株。利用EIA對細菌培養分離株進(jìn)行進(jìn)一步測試,主要是鑒定艱難梭菌菌株是否產(chǎn)毒 [5]。
傳統實(shí)驗室的C.diff測驗都是根據以下三種方法中的一種或者結合幾種進(jìn)行的:細胞培養測定中的細胞毒素檢測; 艱難梭菌毒素A、腸毒素、或者毒素A和毒素B的酶免疫測定(EIA)檢測; 艱難梭菌的厭氧培養。[6]
2.1 細胞培養測定中的細胞毒素檢測
過(guò)濾的糞便抽提物加到微量滴定板上處于生長(cháng)的健康的單層細胞中,培養48h。如果樣本中存在細胞毒素(一般是艱難梭菌毒素B),將會(huì )導致單層細胞聚集,脫離板(稱(chēng)為細胞病變效應,CPE)。非特定細胞毒素的鑒別是通過(guò)加入向第二個(gè)孔(孔內有病人的糞便抽提物)加入特定的抗毒素(實(shí)際上是培育一種相似的微生物C. sordellii)。只有起始的CPE是由于艱難梭菌毒素B引起的,在相應的孔中抗毒素才會(huì )阻止CPE。一般認為,細胞毒素中和(CTN)測定是實(shí)驗室檢測中最靈敏和精確的,但是存在兩個(gè)主要的缺點(diǎn):出結果的速度不夠快,從而影響了及時(shí)的臨床診斷;這種方法需要專(zhuān)業(yè)的技術(shù)和連續的組織培養[7]。
2.2 艱難梭菌毒素A、腸毒素、或毒素A和毒素B的酶免疫測定(EIA)檢測
一些商業(yè)產(chǎn)品通過(guò)檢測在主要存在于有生長(cháng)力的艱難梭菌細胞的一種蛋白質(zhì),叫谷氨酸脫氫酶(GDH),結合毒素檢測。因為糞便中的毒素易分解,特別是如果在轉移到實(shí)驗室的過(guò)程中經(jīng)過(guò)耽誤,毒素測驗很可能會(huì )錯誤地成陰性,然而GDH是相當穩定的,通?梢员砻魑⑸锏拇嬖。這種方法的缺點(diǎn)包括缺乏靈敏性,一些菌株毒素的改變使得不能被商業(yè)化產(chǎn)品檢測出來(lái);一些無(wú)毒素的艱難梭菌也可分泌出GDH(假陽(yáng)性結果);一次進(jìn)行這些檢測的費用;如果EIA測驗是成批進(jìn)行以提高工作流程和成本效益,將會(huì )使周轉時(shí)間延長(cháng)。
2.3 艱難梭菌的厭氧培養
培養是所有檢測中最靈敏的方法。但是必須進(jìn)行二次檢測以判斷產(chǎn)物毒素是否存在,因為非毒性菌株還是比較常見(jiàn)的。這就延長(cháng)了出結果的周轉時(shí)間。另外,艱難梭菌的芽孢是極其堅固的,但是有生長(cháng)力的形式卻比較脆弱,必須維持厭氧環(huán)境以使其恢復生長(cháng)。一種特殊的介質(zhì)——環(huán)絲氨酸-頭孢西丁果糖瓊膠(CCFA),必須在厭氧環(huán)境下儲存并培養48h,以達到最佳的恢復。因為培養技術(shù)的困難和結果輸出的延遲,在相對很少的檢測性實(shí)驗室中會(huì )對艱難梭菌進(jìn)行培養。早先的研究區分疾病通常包括在內鏡檢查術(shù)下宏觀(guān)觀(guān)察粘膜的外觀(guān),通過(guò)組織病理學(xué)比較(假膜是由剝落的細胞組成的白色或者黃色粗糙的物質(zhì)構成),或者在結腸粘膜的活體組織上觀(guān)察到的的微觀(guān)病變。目前這種有擴散性的檢測在今天已經(jīng)幾乎不被利用了,實(shí)驗室測驗是檢測的主要模式。這使得測驗和標準的選擇至關(guān)重要。
最近已經(jīng)有文獻報道了采用兩步方法后的更好的結果:對微生物本身非常靈敏的檢測,首先利用EIA檢測GDH,緊接著(zhù)對細胞毒素和中和的二次檢測。因為在所有病人的糞便標本中的艱難梭菌,對GDH的快速檢測將都是陽(yáng)性的,不管毒素的性質(zhì)是否已經(jīng)在運輸過(guò)程中分解,這種方法是最靈敏的。糞便在其最初的檢測中被認為是陰性的,即可立刻被報告時(shí)陰性的。因為第一個(gè)樣本是最有價(jià)值的?醋o者可以進(jìn)行其他的檢測方法,并使得改變抗生素療法決定的立即必要性得到阻止。實(shí)驗室必須繼續進(jìn)行細胞毒素測定,這使得周轉時(shí)間增加,或者培養和毒素測驗的時(shí)間增加。然而,兩步方法是最有效的。
2.4 傳統檢測方法面臨的困境
無(wú)論是CTA還是艱難梭菌培養都需要耗費大量時(shí)間和勞動(dòng)力 。艱難梭菌檢測時(shí)間的延長(cháng)將導致拖延對艱難梭菌陽(yáng)性個(gè)體的治療;鑒定為假陽(yáng)性可能導致使用抗生素應對個(gè)體艱難梭菌感染。這也可能導致個(gè)體被誤診為艱難梭菌感染,而與真正艱難梭菌陽(yáng)性病人共用同一間病房。
目前,一個(gè)更加致命的抗氟喹諾酮的限制性核酸內切酶B1族艱難梭菌菌株在世界很多地方已經(jīng)被越來(lái)越多地檢測出來(lái)[8,9]。這種新型菌株是通過(guò)其產(chǎn)物雙毒素(CDT)及毒素A和毒素B抑制劑基因位點(diǎn)tcdC的部分缺失加以區別的。
由于與新克隆相關(guān)的增加的致病率和死亡率,病菌的檢測迫在眉睫,因為甲硝唑的效力逐漸下降,萬(wàn)古霉素應該盡可能地避免使用,甚至新的含益生菌的治療方法已經(jīng)流行起來(lái)[10,11]。內科醫生確實(shí)需要一種更加可信和效率的檢測。
3 艱難梭菌的快速檢測方法
目前市場(chǎng)上有很多艱難梭菌快速檢測方法,其中以Meridian Premier C. difficile Toxin A+B ELISA, TechLab Tox A/B Quik Chek, TechLab Toxin A/B II, ImmunoCard Toxin A&B的檢測效果相對較好。ImmunoCard Toxin A&B test最大化地縮短了檢測時(shí)間,整個(gè)過(guò)程為16-24分鐘。另外,這種測驗是一個(gè)單項測驗EIA,可能在臨時(shí)檢測的應用上是實(shí)用可行的。其他的快速檢測方法需要自動(dòng)板閱讀設備、板清洗機、離心機或者一些消耗品(如不包括在檢測試劑盒在內的準備試劑盒等)。大多數的研究都強調,需要更加縝密的方法如CTA或者厭氧培養等,以確認快速檢測的結果。另外,快速檢測可以用來(lái)作為鑒定艱難梭菌陽(yáng)性個(gè)體的初步的篩選方法,可以減少在艱難梭菌感染檢測的延誤。但是這些快速檢測普遍存在靈敏度低和陽(yáng)性預測值率等缺點(diǎn)[5]。因此,臨床上迫切需要一種快速靈敏的艱難梭菌檢測方法。
4 艱難梭菌分子生物學(xué)檢測方法
目前的有研究表明,利用分子學(xué)方法進(jìn)行艱難梭菌檢測更有效[12,13]。 Peterson 等評價(jià)了real- time PCR檢測是利用引物以毒素B基因的一段保守區域為靶點(diǎn)。 由于所有產(chǎn)毒菌株都攜帶毒素B(有些缺少毒素A),這被視為是產(chǎn)毒菌株的很好的替代標記。
這個(gè)研究是分兩個(gè)階段進(jìn)行。第一階段是將送到實(shí)驗室的618個(gè)艱難梭菌檢測標本,進(jìn)行普通的EIA測驗與PCR測驗比較。與結合毒素測驗的厭氧培養的金標準比較,EIA的靈敏度為67%,精確度為92%,而PCR的靈敏度為94%,準確度為97%。在這個(gè)階段,調查者還設定了一套明確艱難梭菌相關(guān)性腹瀉診斷的標準,并發(fā)現幾乎所有真正的CDAD病例每天會(huì )有3次或者更多的排便。對符合該標準的采自病人的370個(gè)標本,PCR檢測的靈敏度比EIA的更高(93% vs. 73%)。real-time PCR和厭氧培養測定皆比酶免疫測定(EIA)更加靈敏(P<.01 to P<.05)。作者總結,與EIA相比,real-time PCR是一個(gè)更加靈敏,相對迅速的測驗,應該在臨床實(shí)踐中考慮替代用來(lái)檢測毒性艱難梭菌的酶免疫測定。
目前市場(chǎng)上推出的艱難梭菌快速分子檢測有BD GeneOhm real-time PCR test和Cepheid公司的GeneXpert C. difficile快速檢測方法等。Stamper等(2009)評價(jià)了BD GeneOhm real-time PCR test的檢測效果,引用的標準是商業(yè)化應用的CTA(Wampole C.difficile Toxin B test)。通過(guò)研究表明,GeneOhm的靈敏度為83.6% (95% CI: 74.3% to 92.9%) ,精確度為98.2% (96.8% to 99.6%),PPV 和NPV分別為 89.5% (81.5% to 97.4%) 、97.1% (95.3% to 98.9%)。整個(gè)GeneOhm real-time PCR test大概需要3h,而一般CTA需要24-48h,厭氧培養的時(shí)間大約為5天。作者總結認為,GeneOhm是一個(gè)快速靈敏的C.difficile分子檢測方法[14]。
而Cepheid公司推出的GeneXpert C. difficile快速分子檢測,具有更強大的優(yōu)勢。整個(gè)檢測過(guò)程僅需要30分鐘。與肉湯富集產(chǎn)毒培養進(jìn)行比較,其靈敏度為93.5%,精確度為94.0%。與現有的PCR檢測、細胞毒素測定、EIA等各種檢測方法比較,其具有高度的靈敏度。因此,相比之下,GeneXpert C. difficile檢測是一種更加快速、靈敏的檢測方法。
參考文獻
[1] Chan EL, Seales D, Drum H. Comparing ImmunoCard with two EIA assays for Clostridium difficile toxins.Clin Lab Sci. 2009, 22(2): 81-85.
[2] LaMont JT. Clinical manifestations and diagnosis of Clostridium difficile infection. In: Uptodate. [database online]. Waltham (MD): Uptodate; 2009. Available: (accessed 2009 Jun 25).
[3] Rüssmann H, Panthel K, Bader RC, et al. Evaluation of three rapid assays for detection of Clostridium difficile toxin A and toxin B in stool specimens. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2007, 26(2):115-119. Available: (accessed 2009 Jun 26).
[4] Clostridium difficile detection and identification methods. Derryduff (Ir): Rapidmicrobiology, 2007. Available: (accessed 2009 Jun 25).
[5] Rapid Response Testing for the Detection of Clostridium difficile: A Review of the Diagnostic Accuracy.Canadian Agency for Drugs and Technologies in Health. 2009: 1-11.
[6] The Cepheid On-Demand Report . Clostridium difficile (C.diff): A Difficult Diagnosis. June- September, 2008: 3-4.
[7] Whittier S, Shapiro DS, Kelly WF, et al. “Evaluation of four commercially available enzyme immunoassays for laboratory diagnosis of Clostridium difficile-associated diseases.”J.Clin.Microbiol. 1993, 31(11) : 2861-65.
[8] Loo VG, Poirier L, Miller MA, et al. “A predominantly clonal multi-institutional outbreak of Clostridium difficile-associated diarrhea with highmorbidity and mortality.” N.Engl.J.Med. 2005, 353(23): 2442-49.
[9] McDonald, Killgore GE, Thompson A, et al. “An epidemic, toxin gene-variant strain of Clostridium difficile.” N.Engl.J.Med. 2005, 353(23): 2433-41.。
[10] Peterson LR, Manson RU, Paule SM , et al. Detection of toxigenic Clostridium difficile in stool samples by real-time polymerase chain reaction for the diagnosis of C. difficile - associated diarrhea. Clin. Infect. Dis. 45.9 (2007): 1152-60.
[11] Sullivan A, Nord CE. “Probiotics and gastrointestinal diseases.” J. Intern.
Med. 257.1 (2005): 78-92.
[12] Sloan LM, Duresko BJ, Gustafson DR, Rosenblatt JE. Comparison of real-time PCR for detection of the tcdC gene with four toxin immunoassays and culture in diagnosis of Clostridium difficile infection. J Clin Microbiol. 2008, 46(6): 1996-2001.
[13] NHS Purchasing and Supply Agency. CEP08054 - Evaluation report: clostridium difficile toxin detection assays. In: CEP catalogue. [database online]. London (UK): NHS Purchasing and Supply Agency; 2009. Available: (accessed 2009 Jun 25).
[14] Stamper PD, Alcabasa R, Aird D, et al. Comparison of a commercial real-time PCR assay for tcdB detection to a cell culture cytotoxicity assay and toxigenic culture for direct detection of toxin-producing Clostridium difficile in clinical samples. J Clin Microbiol
2009;47(2):373-8. )
上一篇:微生物與污水凈化
下一篇:食品腐敗變質(zhì)的危害