酵母遺傳學(xué)方法
1)總酵母RNA的分離
1.在每毫升培養物中加入50μg環(huán)乙酰亞胺,在30℃下振蕩15分鐘。此步亦可省略,但是有人認為環(huán)乙酰亞胺可防止mRNA凝集在多核糖體上。
2.迅速冷凍收集細胞,在大離心管中加入約一半體積的碎冰,將培養物倒入,振蕩,在4℃下以5000r/min離心5分鐘。
3.加入11g玻珠于30ml離心管中,以Corex玻璃離心管為最佳,不過(guò)塑料離心管也能使用。
4.加入3ml已用LETS緩沖液平衡的苯酚到玻珠中。
LETS緩沖液:
0.1 mol/L 氯化鋰
0.01 mol/L Na2EDTA
0.01 mol/L Tris-HCl (pH7.4)
0.2% SDS
0.1% 二乙基焦碳酸(可任選)
5.用2.5ml冰預冷的LETS緩沖液懸浮細胞,并將其加入到上述玻珠苯酚管中。為了使細胞破碎的最好,液面應剛好高于玻珠表面。
6.高速振蕩30秒后,在冰上置30秒,交替進(jìn)行3分鐘,用相差顯微鏡檢測細胞破碎情況,破碎的細胞呈現無(wú)折射的空細胞。
7.當至少90%細胞破碎后,用5ml冰預冷的LETS緩沖液,輕微振蕩,用Sorvall SS-34轉頭以8000r/min離心5分鐘,使溶液分相。離心后,酚層和蛋白質(zhì)界面應剛好低于玻珠表面,移出水相而不會(huì )觸動(dòng)界面。
8.將水相轉到一個(gè)干凈離心管,用5ml苯酚:氯仿:已戊醇(25:24:1)抽提2次,避免觸動(dòng)界面。用氯仿抽提一次。
9.加入1/10
體積的5mol/L氯化鋰,在-20℃下沉淀3小時(shí)。此時(shí),RNA沉淀可在-20℃下存放。
2)Poly(A)+RNA的分離
1.將保存的RNA用Sorvall SS-34轉頭以10 000r/min離心10分鐘,收集RNA沉淀,用80%乙醇洗滌。真空干燥后,溶于2.5ml蒸餾水中,溶解后加入2.5ml 2×上樣緩沖液,同時(shí)加SDS至終濃度為0.3%。
2.置65℃保溫5分鐘。
3.裝一個(gè)oligo(dT)柱,用1×上樣緩沖液洗3次。
4.用10mmol/L HEPES(pH7)洗脫Poly(A)+RNA。如果希望得到更滿(mǎn)意的結果,可用加入RNase抑制劑。
5.用蒸餾水對Poly(A)+RNA進(jìn)行10倍稀釋?zhuān)ㄟ^(guò)OD260的光吸收測定RNA濃度。用水將10mmol/L HEPES(pH7)稀釋10倍作為對照。
6.加1/10體積3mol/L醋酸鈉和2.5倍體積的無(wú)水乙醇沉淀RNA,上下倒置混勻,在-70℃下放置30分鐘。離心10分鐘,棄上清液,用水溶解RNA沉淀使終濃度為1mg/ml。不管是溶解的RNA或是乙醇沉淀的RNA都能在-70℃下長(cháng)期保存。
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