臨床微生物學(xué)檢驗數據管理系統及應用

摘要：目的 建立臨床微生物檢驗數據管理系統，實(shí)現與檢驗信息管理系統（LIMS）一體化網(wǎng)絡(luò )管理。方法  根據微生物學(xué)檢驗要求，由微生物檢驗專(zhuān)業(yè)人員與軟件開(kāi)發(fā)工程師共同研制數據管理系統，將儀器、手工檢驗數據互聯(lián)，并入檢驗信息管理系統（LIMS）及醫院信息管理（HIS）。結果  研制出了功能齊全、操作方便的臨床微生物學(xué)檢驗數據管理系統，并能與LIMS系統及HIS一體化網(wǎng)絡(luò )管理。結論  該系統運行效果衣好，值得推廣和應用。

 

    隨著(zhù)檢驗醫學(xué)和電腦網(wǎng)絡(luò )技術(shù)的快速發(fā)展，檢驗醫學(xué)系統化網(wǎng)絡(luò )管理日趨普及，檢驗信息管理系統（LIMS）在檢驗科工作中的作用尤為重要。但由于臨床微生物檢驗數據類(lèi)型與臨床生化、免疫、血液等差異較大，在實(shí)現檢驗網(wǎng)絡(luò )一體化方面有一定難度，因此，臨床微生物學(xué)檢驗數據管理僅僅停留在單機數據傳輸、中文報告單打印等簡(jiǎn)易功能上。我院與上海齊效電腦科技有限公司共同研制開(kāi)發(fā)了LIMS中的微生物檢驗模塊，并實(shí)現與醫院信息管理系統（HIS）互聯(lián)，運行效果良好，報道如下：

 

1 材料與方法

 

1.1 設備與材料  電腦：DELL OPTIPLEX GX50；全自動(dòng)細菌鑒定藥敏分析儀（VITEK-32），法國生物梅里埃公司產(chǎn)品；全自動(dòng)血培養儀，美國B(niǎo)-D分公司產(chǎn)品；帶條形碼的無(wú)菌痰杯和試管；手工微生物學(xué)檢驗數據。

 

1.2 方法　根據微生物學(xué)檢驗操作流程、微生物學(xué)檢驗數據特點(diǎn)，質(zhì)量控制要求等，由微生物檢驗專(zhuān)業(yè)人員提出設計要求，軟件開(kāi)發(fā)工程師編制程序，采用“生命周期法”，即開(kāi)發(fā)、應用、更新、升級相結合的方法，將儀器、手工檢驗數據互聯(lián)，并入LIMS系統及HIS系統。

 

2 結果與討論

 

2.1 系統參數設置  建立微生物學(xué)檢驗必需的基本數據庫，如菌種名稱(chēng)、檢驗項目、藥敏試驗種類(lèi)等�？筛鶕�各實(shí)驗室的具體需求設定條目，如藥敏試驗方法，各種細菌測試的藥敏種類(lèi)等。

 

2.1.1  細菌字典定義：設立菌種名稱(chēng)，檢驗項目，以及設立每種細菌應做的藥敏試驗等，如“血培養五天”，“抗酸染色”。為方便檢索，設置了項目代碼、拼音碼等。

 

2.1.2  細菌試驗板定義：K-B法藥敏試驗，參考NCCLS標準選擇測試抗生素，分為腸桿菌科、葡萄球菌、銅綠假單胞菌和不動(dòng)桿菌組等；全自動(dòng)細菌鑒定藥敏分析儀，則按測試卡分組，如VITEK系統的GNS-121，GPS-107等。

 

2.1.3  藥敏字典定義：設置藥敏試驗中抗生素名稱(chēng)條目，每一條目對應唯一代碼，在輸入藥敏試驗結果時(shí)可按試驗分組成批輸入或單個(gè)插入輸入。

 

2.2  標本申請信息錄入　采集標本的容器，如痰杯、血培養瓶、無(wú)菌試管等，粘貼有微生物檢驗（咖啡色）專(zhuān)用條形碼，護士工作站工作人員通過(guò)條碼掃描器將條形碼掃入電腦與病人基本信息、標本種類(lèi)、檢驗項目等（這些信息來(lái)自醫生的電子醫囑）關(guān)聯(lián)，共同存入LIMS中。標本送達微生物室時(shí)，只需在電腦終端通過(guò)微生物工作站界面的標本錄入窗口，掃描標本標簽上的條碼或鍵盤(pán)輸入該條碼號，即可獲得上述信息，確認后會(huì )自動(dòng)計賬收費，然后開(kāi)始檢驗。此外，如果無(wú)網(wǎng)上電子醫囑和護士工作站錄入，標本達到檢驗科時(shí)，也可采用手工方法錄入，以化驗單聯(lián)號碼作為標本唯一標志錄入,通過(guò)住院號獲得病人基本信息，再根據化驗申請中的信息，輸入標本種類(lèi)、檢驗項目等等。

 

2.3  微生物檢驗操作流程記錄　　為規范臨床微生物檢驗操作，提高檢驗質(zhì)量，上海市臨床檢驗中心規定每份微生物檢驗標本必須有完整的“操作程序記錄”。為此，我們研制出了電子版的檢驗程序記錄”，如表1所示。詳細記錄從標本采集到最終報告發(fā)送的每一操作過(guò)程：①實(shí)時(shí)記錄標本采集時(shí)間、收到時(shí)間以及接種時(shí)間。能真正做到客觀(guān)、真實(shí)。②方便記錄標本種類(lèi)、涂片結果、所接種的培養基、培養條件等；常用條目設置為“默認”。③預先設置“固定模塊”，快速記錄“菌落性狀、生化反應”，如“血平板上菌落灰白/黃色，扁平，光滑，邊緣整齊，直徑3mm左右圓形菌落，β-溶血”；麥康凱平板上為粉紅色，黏液樣菌落，隆起飽滿(mǎn)，直徑3mm左右”，“觸酶陽(yáng)/陰性”，“氧化酶陽(yáng)/陰性”等，可靈活調用及修改。

表1　微生物檢驗程序記錄

同濟醫院微生物學(xué)檢驗程序記錄         標本號0001621

標本種類(lèi) 痰 菌落性狀、生化反應（血清學(xué)試驗）

收到時(shí)間：7.4.8:00

接種時(shí)間：7.4.8:05 7.5麥康凱平板上為粉紅色菌落，扁平，濕潤，直徑3mm左右。革蘭陰性桿菌，氧化酶陰性。

涂片結果：G-b

接種培養基：血平板、麥康凱、巧克力平板

培養條件：①35℃，5%CO2；18～24h 藥敏結果：自動(dòng)分析儀（記錄存盤(pán)）

最終報告：鮑曼不動(dòng)桿菌4+  

記錄人：黃曉霞                          記錄日期：2003.7.7

 

2.4檢驗報告處理　報告處理窗口如圖1（略）所示，按檢驗項目（或住院/門(mén)診號、條碼號、庫位號等靈活選用）檢索出待發(fā)報告的病人信息；細菌名稱(chēng)（或檢驗項目）輸入，采用拼音碼，如“fk”表示“肺炎克雷伯菌”，“ks”即“抗酸染色”；菌名彈出的同時(shí)，右側窗口跳出對應的藥敏試驗條目，輸入結果，保存即可。如數據來(lái)自?xún)x器，則自動(dòng)完成數據入庫、轉換與其它檢驗報告采用統一模式，在檢驗報告單的首行印有“微生物”及“報告日期”等字樣，報告單貼在病歷上時(shí)，首行留出，具有標準、規范、無(wú)污染、易粘貼和查找等優(yōu)點(diǎn)；所有報告單在任一指定終端均可打印，如各病區可打印本病區歷史或在院的所有報告單。

 

2.6  流行病學(xué)統計　定期為臨床提供病原菌分布以及耐藥性監測報告是院內感染監測的重要內容之一。本系統的流行病學(xué)統計功能，在快速提供準確、全面的監測報告方面優(yōu)勢特別明顯。微生物檢驗數據永久性?xún)Υ嬗诜��?wù)器里，可根據需要提供多參數查詢(xún)和統計，如統計標本陽(yáng)性率，菌種分布百分率，抗菌藥物敏感百分比等，圖2（略）所示。此外，還能統計和打印一些有意義的清單，例如某期間內“抗酸桿菌”或“淋球菌涂片”陽(yáng)性病人等，快速、方便、準確。

 

2.7  查詢(xún)  在微生物檢驗數據查詢(xún)方面，功能齊全，較手工方法具有無(wú)可比擬的優(yōu)越性，例如查詢(xún)某病人歷次分離菌及藥敏資料，指定住院/門(mén)診號（或姓名等）、日期范圍，立刻就能檢索出來(lái)，方便對比查閱。

 

2.8  分級報告　微生物檢驗實(shí)驗室數據網(wǎng)絡(luò )管理系統，在實(shí)驗檢驗結果的分級報告方面優(yōu)勢更加明顯，如標本涂片革蘭氏染色結果，“初步報告”上網(wǎng)發(fā)送，護士工作站實(shí)行彈出消息，臨床醫師即可據此及時(shí)進(jìn)行診斷和治療，待正式報告出來(lái)之后作相應的調整，為挽救病人贏(yíng)得寶貴時(shí)機。

 

    由于使用網(wǎng)絡(luò )條碼技術(shù)，不僅方便、快捷，最大限度地避免了標本混淆、錯留，同時(shí)因無(wú)需紙質(zhì)申請單，又可避免污染，減少核對、驗收的工作；此外，標本從采集、傳送、接種、報告結果等整個(gè)環(huán)節的時(shí)間準確記錄在系統中，留存在報告單上，不僅能監督多環(huán)節規范操作，而且促使檢驗人員嚴把質(zhì)量關(guān)，提高檢驗質(zhì)量。

 

作者：袁應華，萬(wàn)海英   同濟大學(xué)附屬同濟醫院檢驗科  摘自《現代檢驗醫學(xué)雜志》2003年第6期