細胞培養中細菌類(lèi)微生物污染的快速檢測

［摘 要］ 目的  檢測細胞培養中細菌類(lèi)（包括支原體）微生物的污染情況。 方法  用細胞培養中常見(jiàn)的培養物人為污染He-La細胞，設計細菌類(lèi)微生物16S rRNA基因序列通用引物，PCR擴增16S rRNA基因序列片斷，建立PCR檢測培養細胞污染的方法，并用該方法檢測本室保存的細胞株的污染情況。結果  人為污染綠膿桿菌、大腸桿菌、白色葡萄球菌和支原體M.fermentans的Hela細胞的培養上清中均擴增出大小的片段，與目的片段相符。本室所收藏的15個(gè)細胞株有3株的培養上清中擴增出大小的片段。 結論  本實(shí)驗建立了16S rRNA基因序列通用引物PCR法，可用于快速檢測培養細胞中細菌類(lèi)微生物的污染。      

　�。坳P(guān)鍵詞］ 細胞培養;細菌;污染;PCR      

　　Rapid detection of bacterial or microbial contamination in cell cultures

           

　　Abstract:Objective To investigate a fast and simple method to detect bacterial contaminations including Mycoplasma contamination in cell cultures.Methods HeLa cells were used for propagation P.aeruginosa，E.coli，S.epidermidis and M.fermentans，respectively.The suit-ability of PCR based on the universal primers for the16S rRNA gene sequences of prokaryotic cells for the detection of bacterial contamination in He-La cell cultures was investigated.Then this method was used to test15cell strains in our laboratory.Results Nearly1500bp region was amplified from all of the HeLa cell cultures contaminated by P.aeruginosa，E.coli，S.epidermidis or M.fermentans.Of the15cell strains in our labora-tory，3were tested positive using this method.Conclusion The PCR method based on the universal primers for the16S rRNA region of prokaryotic cells might be used for the rapid detection of bacteria in cell cultures.

     

　　Keywords:cell culture;bacteria;contamination;PCR

      

　　細胞培養被微生物污染，是常見(jiàn)而又嚴重影響細胞培養后續研究工作的問(wèn)題。微生物污染包括真菌類(lèi)，細菌類(lèi)（包括支原體）以及病毒類(lèi)對培養物的污染。其中真菌污染后不難被發(fā)現，而病毒污染的檢測應根據不同的病毒選用不同的方法，而且需要建立相應的參照系統，屬于病毒學(xué)范疇，在普通實(shí)驗室不易推廣。細菌類(lèi)微生物，特別是某些細菌和支原體污染后，對培養液無(wú)肉眼可見(jiàn)影響，是細胞培養中最常見(jiàn)，不易被察覺(jué)又干擾實(shí)驗結果的問(wèn)題［1-5］ 。因此，檢測并消除細菌類(lèi)微生物污染在細胞培養工作中至關(guān)重要。PCR技術(shù)用于檢測培養物中支原體污染的研究已有報道［1-4］ ，但由于培養物的DNA提取以及PCR技術(shù)本身要求的實(shí)驗條件及成本較高，在普通實(shí)驗室不易推廣;設計的引物如果不能涵蓋所有的支原體種也容易造成檢測標本的假陰性［3］。本實(shí)驗采用煮沸法粗提DNA，合成細菌類(lèi)16S rRNA特異性序列通用引物，用PCR擴增法對培養物進(jìn)行檢測，真正做到廉價(jià)、靈敏、簡(jiǎn)便和快速。而且早期即可以檢測到細胞培養中細菌類(lèi)微生物的污染，對于污染后的挽救也有重要意義。

    

　　1 材料與方法

　　1.1 細菌參考株      

　　綠膿桿菌、大腸桿菌、白色葡萄球菌，由本室保存;支原體M.fermentans等，由北京軍事醫學(xué)科學(xué)院溫博海教授惠贈。

　　1.2 細胞株    

　　無(wú)支原體污染的HeLa細胞，由保井孝太郎教授惠贈。作為陰性對照和實(shí)驗室人為污染的細胞樣品。本室所收藏的細胞系共15個(gè)細胞株。    

　　1.3 實(shí)驗室人為污染HeLa細胞    

　　分別刮取各種常見(jiàn)細菌冰晶，接種于LB培養基，支原體接種于牛心浸液，37℃過(guò)夜培養。取50μl上述培養物接種于新傳代的HeLa細胞，共同培養。    

　　1.4 細菌基因組DNA的煮沸法小量制備    

　　取各個(gè)感染組的培養上清，12000r.min離心30s，棄上清后加入200μl PBS重懸，將重懸液于沸水（100℃）中煮5min，12000r.min離心15min，吸出上清移入一個(gè)新的EP管中，加入冰預冷的異丙醇200μl，于-20℃放置15min。12000r.min離心5min，棄上清，用50μl TE緩沖液重懸。

　　1.5 PCR擴增    

　　PCR擴增細菌類(lèi)16S rRNA特異性序列通用引物［6-7］ 。上游引物（A-17）:5′-GTT TGA TCC TGG CTC AG-3′;下游引物（3-17）:5′-AAG GAG GTA ATC CAG CC-3′;擴增片段大小約1500bp。

2 結果    

　　2.1 檢測細胞培養中細菌類(lèi)微生物污染的通用性    

　　本實(shí)驗所用的引物是根據溫博海等［7］設計的原核細胞16S rRNA基因序列通用引物。人為污染綠膿桿菌、大腸桿菌、白色葡萄球菌，以及支原體M.fermentans的Hela細胞的培養上清中均擴增出約1500bp大小的片段，與目的片段相符（圖1）。    

　　    

　　圖1 PCR方法的通用性檢測結果（略）

    

　　2.2 靈敏度檢測      

　　根據紫外分光光度計A值計算，煮沸法小量制備的細菌基因組DNA的濃度為13μg.ml，10倍系列稀釋后，分別取1μl作為模板進(jìn)行PCR擴增。當模板濃度降低到52fg.ml時(shí)，在1500bp處仍可見(jiàn)明顯的擴增條帶（圖2）。    

　　　圖2 PCR方法的靈敏度檢測結果（略）

    

　　2.3 初步應用      

　　用上述方法檢測了本室所凍存的11個(gè)細胞系中凍存批次較早細胞（表1），其中有3個(gè)批次的培養上清中擴增出1500bp大小的片段，認為該批次的凍存細胞污染了細菌類(lèi)微生物，考慮到這些細胞系較廉價(jià)，故將該批次以及來(lái)自該批次來(lái)源的其他凍存細胞丟棄。

     　　表1 本實(shí)驗檢測的體外培養細胞株（略）

   

　　3 討論      

　　細胞培養被細菌類(lèi)微生物（包括細菌和支原體）污染，是常見(jiàn)而又嚴重影響細胞培養后續研究工作的問(wèn)題。特別是支原體污染，對體外培養的細胞的幾乎所有的指標及產(chǎn)物均有影響，而且可以不被察覺(jué)地隨著(zhù)細胞的傳代而傳代［1-5］ 。早在1994年Wirth等［1］ 就利用PCR技術(shù)檢測培養物中支原體的污染，但由于培養物的DNA提取以及PCR技術(shù)本身要求的實(shí)驗條件和成本較高，在普通實(shí)驗室不易推廣;而且設計的引物如果不能涵蓋所有的支原體種也容易造成檢測標本的假陰性［3］。所以多數實(shí)驗室寧可將懷疑有污染的細胞丟棄，也不進(jìn)行檢測。本實(shí)驗采用煮沸法粗提DNA，合成原核微生物16S rRNA特異性序列通用引物，用PCR擴增法檢測細胞培養物中是否有原核微生物的存在，建立了簡(jiǎn)便廉價(jià)且靈敏快速的細胞培養中細菌類(lèi)微生物污染的檢測方法。   

　　本實(shí)驗采用煮沸法粗提細菌基因組DNA，成本低且簡(jiǎn)便易于操作，當模板量降低到52fg.ml時(shí)用PCR法仍可擴增出目的條帶，說(shuō)明該方法比較靈敏快速，可以在污染的較早期迅速檢測到污染的存在，對一些珍貴細胞的挽救非常重要。另外，16S rRNA基因序列是原核生物特有的基因序列而且比較保守，在細菌的分類(lèi)中被認為是分子進(jìn)化鐘［6-7］ ，本實(shí)驗利用通用引物擴增這一區段，還可以進(jìn)一步測序證實(shí)污染物的種類(lèi)，以便進(jìn)行有針對性的挽救。

    作者：萬(wàn)穎杰，張俊磊，安靜《局解手術(shù)學(xué)雜志》

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