微生物分類(lèi)單元的命名

　　生物名稱(chēng)分兩類(lèi)，一類(lèi)是區域性的俗名（vernacular name）；另一類(lèi)是國際上統一使用的名稱(chēng)，即學(xué)名（scientific name）。

　　俗名是一個(gè)國家或地區使用的普通名稱(chēng)，如我們把引起人結核病的細菌叫“結核桿菌”，而英語(yǔ)稱(chēng)“tubercle bacillus”，而俄語(yǔ)則稱(chēng)“tyбepkyлёзная палочка”。俗名的優(yōu)點(diǎn)是在一定的區域內通俗易懂便于記憶，但俗名有局限性，尤其是不便于國際間的交流。所以為了使生物分類(lèi)單元的名稱(chēng)能在國際上通用，就需要制定一個(gè)為各國生物學(xué)工作者共同遵守的命名法則，即國際生物命名法規，來(lái)管理生物分類(lèi)單元的命名，以確保生物名稱(chēng)的統一性、科學(xué)性和實(shí)用性�，F在分別由國際動(dòng)物命名法規、國際植物命名法規和國際細菌命名法規來(lái)分別管理各類(lèi)生物的命名。據報道，目前正在制定適用于各類(lèi)生物的統一的國際生物命名法規，預計新的統一的生物命名法規到2000年正式實(shí)施，下面以細菌為例簡(jiǎn)要介紹有關(guān)微生物命名的基本常識。

　　1.分類(lèi)單元的命名 所有正式分類(lèi)單元（包括亞種和亞種以上等級的分類(lèi)單元）的學(xué)名，必須用拉丁詞或其他詞源經(jīng)拉丁化的詞名。 ⑴ 屬名 屬名用一個(gè)單數主格名詞或當作名詞用的形容詞來(lái)表示，可以是陽(yáng)性、陰性或中性，首字母要大寫(xiě)。例如，Bacillus（芽孢桿菌屬）（陽(yáng)性），拉丁詞，原意為“小桿菌”因該屬菌有芽孢而譯為?把挎吒聳艟�”；Clostridium（梭菌屬）（中性），源于希臘詞，原意為“紡錘狀菌”；Salmonella（沙門(mén)氏菌屬）（陰性），以美國細菌學(xué)家D.E.Salmon的姓氏命名。 ⑵ 種名 和其他生物一樣，細菌的種名也用雙名法（binomial nomenclature）命名，即種的學(xué)名由屬名和種名加詞兩部分組合而成。第一個(gè)次為屬名，首字母要大寫(xiě)；第二個(gè)詞為種名加詞，常用形容詞（要與屬名性別一致），也可以用人名、地名、病名或其他名詞（名詞用主格或所屬格形式），種名加詞首字母不大寫(xiě)。例如，Pseudomonas aeruginosa（銅綠色假單胞菌），其中，Pseudomons是屬名（假單胞菌屬）（陰性）；aeruginosa是種名加詞，是拉丁語(yǔ)形容詞（陰性），原意為“銅綠色的”；Mycobacterium tuberculosis（結核分枝桿菌），其中 Mycobacterium是屬名（分枝桿菌屬）系希臘詞源的復合詞（中性），tuberculosis是種名加詞，是希臘詞和拉丁詞綴合成的名詞所屬格形式，意為“結核病的”；Bacillus thuringiensis（蘇云金芽孢桿菌），其中 thuringiensis是種名加詞，它是德國地名Thuringia的拉丁語(yǔ)所屬格形式。當泛指某一屬細菌而不特指該屬中任何一個(gè)種（或未定種名）時(shí)，可在屬名后加sp.或spp.（某些微球菌）。 ⑶ 亞種名亞種名為三元式組合，即由屬名、種名加詞和亞種名加詞構成。例如： Alcaligenes denitrificans subsp. xylosoxydans 屬名 種名加詞 subspecies 亞種名加詞 （產(chǎn)堿桿菌屬）（反硝化的） 的縮寫(xiě)（亞種） （氧化木糖的） 該亞種名可譯為:反硝化產(chǎn)堿桿菌氧化木糖亞種. ⑷ 屬級以上分類(lèi)單元的名稱(chēng) 亞科、科以上分類(lèi)單元的名稱(chēng)，是用拉丁或其他詞源拉丁化的陰性復數名詞（或當作名詞用的形容詞）命名，首字母都要大寫(xiě)。其中細菌目、亞目、科、亞科、族和亞族等級的分類(lèi)單元名稱(chēng)都有固定的詞尾（后綴），其詞尾的構成及例子見(jiàn)表12-4。 此外，在分類(lèi)單元名稱(chēng)的后面還可以附上命名人的姓名和命名年號。例如Staphylococcus aureus Rosenbach 1884，這表明該菌（金黃色葡萄球菌）是由Rosenbach 1884年命名的。屬、種和亞種等級的分類(lèi)單元的學(xué)名在正式出版物中應用斜體字印刷，以便識別。

　　　2. 命名模式及其指定 如前所述，由于細菌分類(lèi)單元的劃分缺乏一個(gè)易于操作的統一標準，為了減少因采用不同標準界定分類(lèi)單元所造成的混亂，細菌系統分類(lèi)也像其他生物分類(lèi)一樣采用“模式概念”。即根據命名法規要求，正式命名的分類(lèi)單元應指定一個(gè)命名模式（簡(jiǎn)稱(chēng)模式）作為該分類(lèi)單元命名的依據。種和亞種指定模式菌株（type strain）；亞屬和屬指定模式種（type species）；屬以上至目級分類(lèi)單元指定模式屬（type genus）。因此，當某一菌株被鑒定為一個(gè)新種或新的亞種時(shí)，該菌株就應指定為該種或該亞種的模式菌株；如果有幾個(gè)菌株同時(shí)被鑒定為一個(gè)新種或亞種，則必須指定一個(gè)較有代表性的菌株作為該種或亞種的模式菌株。模式菌株應送交菌種保藏機構保藏，以便備查考和索取。模式種和模式屬的確定也大體如此。

　　3. 新名稱(chēng)的發(fā)表 根據細菌命名法規的規定，有效發(fā)表新的細菌名稱(chēng)應在公開(kāi)發(fā)行的刊物上進(jìn)行，在菌種目錄、會(huì )議記錄、會(huì )議論文摘要的均不能視為有效發(fā)表。此外，若新名稱(chēng)是在國際系統細菌學(xué)雜志（IJSB）以外的其他雜志上發(fā)表的，要取得國際上承認和學(xué)名優(yōu)先權，還必須經(jīng)過(guò)新名稱(chēng)的合格化發(fā)表，即將有效發(fā)表的英文附本送交IJSB審查，被認為合格后，在該雜志上定期公布，命名日期即從公布之日算起，否則不算合格發(fā)表，也不能取得國際上的承認。發(fā)表新名稱(chēng)時(shí)，應在新名稱(chēng)之后加上所屬新分類(lèi)等級的縮寫(xiě)詞，如新目“ord.nov.”、新屬“gen.nov.”、新種“sp.nov.”等。例如，Pyrococcus furiosus sp.nov.表明該菌（猛烈火球菌）是一個(gè)新發(fā)表的種。

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