目前常用的三種體外 DNA 連接方法為:
① 用 T4或 E.coli DNA連接酶可連接具有互補粘性末端的 DNA片段;
② 用 T4 DNA連接酶連接具有平末端的 DNA 片段;
③ 先在 DNA 片段末端加上人工接頭,使其形成粘性末端,然后再行連接。
④ 將粘性末端補平或修平(用單鏈酶,如綠豆芽核酸酶)連接
柯斯質(zhì)粒用于克隆大片段的 DNA分子特別有效,而這種特性對于研究高等生物的基因組十分重要。其特點(diǎn):
1)具有 λ噬菌體的特性:在克隆了外源片段后可在體外被包裝成噬菌體顆粒,高效地感染對 λ噬菌體敏感的大腸桿菌細胞。進(jìn)入寄主的柯斯質(zhì)粒 DNA分子,按照 λ 噬菌體 DNA的方式環(huán)化, 但無(wú)法按噬菌體的方式生活,更無(wú)法形成子代噬菌體顆粒。
2)具有質(zhì)粒載體的特性:在寄主細胞內如質(zhì)粒一樣進(jìn)行復制,攜帶有抗性基因和克隆位點(diǎn),并具氯霉素擴增效應。
3)具有高容量的克隆能力:柯斯質(zhì)粒本身一般只有 5~7kb左右,而它克隆外源 DNA 片段的極限值竟高達 45kb,遠遠超過(guò)質(zhì)粒載體及 λ 噬菌體載體的克隆能力。同時(shí),由于包裝限制, 柯斯質(zhì) 粒載體的克隆能力還存在一個(gè)最低極限值。 例如,5 kb大小的 柯斯質(zhì)粒載體,插入的外源片段至少不能小于 30 kb。
M13是大腸桿菌絲狀噬菌體,其基因組為環(huán)狀 ssDNA, 大小為 6407bp。其生活史為:
1)通過(guò)性毛感染雄性(F+或 Hfr)大腸桿菌,或通過(guò)轉染進(jìn)入雌性大腸桿菌細胞;
2)進(jìn)入細胞后,轉變成復制型 (RF) dsDNA,然后以滾環(huán)方式制出 ssDNA。每當復制出單位長(cháng)度正鏈,即被切出和環(huán)化,并被立即組裝成子代噬菌體和以出芽方式(即宿主細胞不被裂解)被釋放至胞外。
M13克隆載體是對野生型 M13進(jìn)行改造后建成,其特點(diǎn)是雖然克隆外源 DNA的能力較小,一般只適于克隆 300~400bp 的外源 DNA 片段,但特別適合用于制備克隆基因的單鏈 DNA。主要被用于制備測序用單鏈 DNA模板、特異的單鏈 DNA探針,進(jìn)行定位誘變等,也可用于噬菌體展示。
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