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    腺病毒載體常見(jiàn)問(wèn)題(一)



    錄入時(shí)間:2009-8-17 11:51:37 來(lái)源:青島海博

    6.1 QBI-293A細胞培養
    表現 可能原因 解決方法 
    細胞高死亡率/細胞脫壁/培養液發(fā)黃 支原體、細菌或酵母菌污染 1) 復蘇一管新的細胞
    2) 使用抗生素如鏈霉素和青霉素
    細胞生長(cháng)困難 a) 細胞太少 QBI-293A細胞傳代時(shí)至少為5%匯合率,以保證其在一定時(shí)間內恢復生長(cháng) 
    b) 細胞密度過(guò)高 QBI-293A如果經(jīng)常培養密度過(guò)高,則有產(chǎn)生突變的危險,細胞匯合率切勿超過(guò)70%
    6.2 感染力測定
    表現 可能原因 解決方法
    感染后細胞高死亡率 a) MOI過(guò)高 降低MOI
    b) 細胞內含有內源性病毒(野生型腺病毒可產(chǎn)生輔助病毒樣作用,使非重組腺病毒也能感染細胞) 更換凍存的細胞,初代培養的較適用 ;
    c) 一些細胞株有類(lèi)似E1區活性 若一定要使用該細胞株,改用較低MOI
    不感染 a) MOI太低 1) 嘗試不同范圍MOI。對于293之外的細胞株,MOI一般為1~200,對于某些難于感染的細胞株可能需要更高
    2) 如果使用的是Infect+陽(yáng)性對照,儲存液在應用之前首先應擴增 
    b) 感染條件不夠優(yōu)化 1)任何感染試驗都需以293細胞為陽(yáng)性對照 
    2)以未感染的293作為陰性對照來(lái)監測細胞培養條件
    c) 一些細胞可拮抗腺病毒的感染,需要很高M(jìn)OI 聯(lián)系技術(shù)支持(info•qbi.com)
    6.3 轉移載體克隆
    表現 可能原因 解決方法
    轉化大腸桿菌后無(wú)菌落形成 a) 抗生素應用不當 
    b) 轉化效率差 .
    c) 制備的質(zhì)粒質(zhì)量差 使用50ug/ml卡那霉素
    確證細胞是否具有轉化活性
    用氯化銫或其它方法純化質(zhì)粒
    轉化后有太多菌落形成 培養基中無(wú)抗生素 培養基中加入卡那霉素
    篩選的克隆中無(wú)目的基因 a) 不匹配粘末端連接
    b) 鈍末端連接導致無(wú)轉化
    c) 連接頭太短,不能被有效切割
    d) Taq酶在PCR片段末端產(chǎn)生太多突出性腺嘌呤 確證酶切后DNA粘末端是否匹配加大連接酶量,確證克隆位點(diǎn)已正確應用,Klenow進(jìn)行鈍化 確證連接頭之間有足夠的堿基對以供正確酶切。詳細信息可向內切酶供應商查詢(xún)
    Taq酶在PCR產(chǎn)物3’末端可產(chǎn)生一個(gè)額外的腺嘌呤。必須移去這個(gè)額外的腺嘌呤(可用Klenow)或者使用產(chǎn)生鈍末端的溫度穩定性聚合酶   
    轉移載體重組子的分子量不正確 使用了錯誤的載體或克隆基因 cDNA用膠純化,確保連接前無(wú)其它載體污染 
    限制性?xún)惹忻笩o(wú)法切割質(zhì)粒 a) 甲基化  
    b) 酶已失活
    檢驗切割的序列是否對甲基化敏感,若是,則在對甲基化不敏感的細菌如GM33中擴增質(zhì)粒使用新鮮的酶和制造商推薦的緩沖液
    6.4 在BJ5183細胞中共轉化和重組 
    表現 可能原因 解決方法
    菌落少或無(wú)菌落 a) 轉化效率不夠
    b) 抗生素使用錯誤或濃度過(guò)高
    c) 制備的質(zhì)粒質(zhì)量差 
    d) 細胞轉化活性
    e) 使用了錯誤的細菌株 1) 按照試驗盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行操作,這是一個(gè)關(guān)鍵步驟,必須使用最優(yōu)條件
    2) 向電穿孔儀制造商查詢(xún)適用于這一細胞的特定操作方法
    抗生素為50ug/ml卡那霉素
    1) 用氯化銫或其它方法純化質(zhì)粒
    2) 膠純化可降低背景菌落的形成,但也可能降低了轉化效率。當轉化效率太低時(shí)避免使用膠純化
    1) 試劑盒中提供的細菌都具有電穿孔轉化活性,如果使用其它方法進(jìn)行轉化,則必須將細胞制備為化學(xué)轉化活性
    2) 細菌必須正確保存以免喪失轉化活性,參照推薦的方法保存 
    使用試劑盒中提供的BJ5183細菌株,DH5α僅供用于重組子的擴增,因其無(wú)重組活性。
    菌落過(guò)多 a) 轉移載體和病毒DNA的比率過(guò)高 I^1,
    b) 轉移載體用PmeI線(xiàn)性化不完全
    c) 卡那霉素質(zhì)量差或量不夠 1) PmeI消化后用膠純化或去磷酸化質(zhì)粒
    2) 共轉染時(shí)減少轉移載體的量,推薦比率為:1ug轉移載體:0.1ug超螺旋DAdEasy-1 DNA
    PmeI酶切時(shí)減少DNA量,檢查內切酶是否具有活性
    使用新鮮的卡那霉素,濃度為50ul/ml 

     

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