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    病毒滴度測定



    錄入時(shí)間:2009-8-17 11:49:58 來(lái)源:青島海博

      有很多名詞都用來(lái)描述病毒溶液的滴度。
    1. VP(病毒顆粒)或OPV(光學(xué)顆粒單位)
    2. GTU(基因轉移單位)或轉導顆粒(BFU即藍點(diǎn)形成單位,與GTU類(lèi)似)
    3. PFU(空斑形成單位) 
    4. TCID50(50%組織培養感染劑量) 
    不同的概念緣于不同的滴度測定方法,這些方法包括2類(lèi):物理方法(VP)和生物學(xué)方法(GTU、PFU、TCID50)。
    1. 測定VP的方法是測定病毒顆粒在260nm處的吸光度(病毒DNA和蛋白的總吸光度中主要為DNA),1個(gè)OD值相當于1.1×1012個(gè)病毒顆粒。用這種方法進(jìn)行測定在各個(gè)實(shí)驗室中都較為穩定,但它不能區分感染性和缺陷性病毒顆粒。因此這種方法只能提供病毒的量,至于質(zhì),比如是否含有缺陷性顆粒則沒(méi)有考慮在內。
    2. GTU則測定感染后能表達報告基因的細胞數量。這個(gè)過(guò)程中,病毒將DNA轉入細胞,在一個(gè)感染周期結束前立即測定表達報告基因的細胞。如果重組腺病毒含有報告基因如GFP或LacZ等則可以用這種方法進(jìn)行測定,病毒保存液通常不用這種方法來(lái)進(jìn)行描述。
    3. PFU是測定腺病毒滴度最早的標準方法,主要測定單層細胞培養中病毒裂解空斑的形成?瞻咝纬尚枰S多個(gè)感染周期,得到最終結果通常需要三個(gè)星期。一般來(lái)說(shuō),這種方法得到的結果很少能在其它實(shí)驗室重復,即使在同一實(shí)驗室內,不同技術(shù)員操作也很少能得到相同的結果。
    4. TCID50已被用于測定許多種病毒的滴度,但以前并不用于腺病毒。病毒稀釋液與細胞在96孔板進(jìn)行培養,然后監測每孔是否CPE。TCID50方法相對PFU方法而言有幾個(gè)優(yōu)點(diǎn),如速度是PFU的2倍,結果更具預料性,在不同操作個(gè)體間也更穩定。
    所有生物學(xué)方法所得到的結果在不同實(shí)驗室之間往往有所差異,它主要與病毒感染方法有關(guān)。許多因素如加入的病毒儲存液的量、管子的類(lèi)型、培養的時(shí)間、細胞和培養液的量等都會(huì )影響結果。最近,出現了兩種測定病毒滴度的改良方法。一種是用更小體積的病毒液進(jìn)行感染并在感染過(guò)程中不斷晃動(dòng)培養板(Mittereoler等,1996);另一種方法則在感染時(shí)將培養板進(jìn)行離心(1000 RCF90分鐘)(Nyberg-Hoffman等,1997)。這兩個(gè)實(shí)驗室所得到的結果更為穩定,并證實(shí)以前的方法低估了病毒保存液中感染性病毒顆粒的數量。迄今為止,尚無(wú)一種方法被控制機構認定為測定滴度的標準方法。
    對于同一管病毒保存液,不同的方法所得到的結果往往相差100倍以上,典型的數據見(jiàn)表6。所有結果都只是大概的,目前最有效的生物學(xué)方法(離心法感染)能檢測到1個(gè)感染性顆粒/2個(gè)顆粒。下一部分,我們將詳細描述3種不同的測定病毒滴度的方法。選擇滴定方法要考慮的關(guān)鍵因素包括可重復性、穩定性、敏感性、易用性和耗時(shí)。無(wú)論選擇那種方法,稀釋和滴定過(guò)程必須重復操作以得到精確結果。一般來(lái)說(shuō),用TCID50方法得到的病毒保存液的滴度應為:
          106~107         第一代細胞經(jīng)凍融后
          108~109         100倍數量的細胞經(jīng)過(guò)凍融后
          1010~1011       用氯化銫方法純化后
    表6:各滴度測定方法特性
    方法 類(lèi)型 時(shí)間 可重復性 滴度* 評注 
    VP 物理學(xué)方法 2小時(shí) 好 5×1012
    GTU 生物學(xué)方法 2天 可變 2×1011
    PFU 生物學(xué)方法 21天 變化很大 5×1010 傳統方法
    TCID50 生物學(xué)方法 10天 可變 2.5×1011 昆騰公司標準方法
    以VP法測得的5×1012的病毒保存液為標準
    5.8.1 O.D.260 nm(VP/ml)
    這種方法只是通過(guò)DNA量來(lái)表示病毒滴度。相關(guān)系數為1.1×1012/ OD260 單位。由于大多數分光光度計在OD值小于0.1時(shí)不夠精確,而樣品準備過(guò)程中又至少要稀釋10倍,因此如果 OD值大于0.1,我們可以估計病毒量大于1012。這一方法只可用于測定氯化銫純化后溶于緩沖液中的病毒,因含血清培養基會(huì )干擾吸光度。同時(shí),它也要求病毒濃度足夠高,并且不含缺陷性顆粒。
    1. 4℃融化病毒保存液。
    2. 在無(wú)菌超凈臺內用病毒裂解液(VLB)(0.1%SDS,10mMTris PH7.4,1mMEDTH)準備二個(gè)病毒稀釋度。
    最小需要量為: s 
    病毒裂解液   病毒       稀釋度
    52ul       52ul       1:2(稀釋液1)
    168ul      42ul       1:5(稀釋液2)
    注意:病毒滴度高時(shí)(1013/ml)用1:10和1:20稀釋度,滴度低時(shí)用低稀釋度,保證OD值在0.1~1.0之間。
    3. 56℃震蕩培養10分鐘。  0 uf'gbjf 
    4. 準備1ml含有VLB和透析緩沖液的空白對照溶液,比例同上,以緩沖液代替病毒裂解液。
    5. 測定260nm處吸光值:
    稀釋液1再稀釋1:5,為稀釋液3。
    稀釋液2再稀釋1:5和1:10,分別為稀釋液4和稀釋液5。
    測定稀釋液5(2次)、4、3的OD260,取此4值的平均值作為最終結果。 
    例如
    1. 將450ulVLB和50ul稀釋液即透析緩沖液加入比色杯中。
    2. 記下空白管讀數后棄去,不要沖洗。
    3. 加入450ulVLB和50ul 1:5稀釋樣本(稀釋液2),組成稀釋液5。
    4. 記下讀數后棄去。
    5. 清洗比色杯,加入樣本重復測一次。
    6. 清洗比色杯,加入400ul VLB和100ul 1:5稀釋空白液。 
    7. 記下空白管讀數后棄去,不要清洗。
    8. 加入400ul VLB和100ul 1:5稀釋樣本,組成稀釋液4。
    9. 記下讀數后棄去。
    10. 清洗比色杯,加入400ul VLB和100ul 1:2稀釋空白液。
    11. 記下空白讀數后棄去,不要清洗。
    12. 加入400ul VLB和100ul 1:2稀釋樣本,組成稀釋液3。
    13. 記下讀數后棄去。
    將吸光值與稀釋度相關(guān)系數相乘即可得出病毒滴度:
    OD260×病毒稀釋度×測定稀釋度×1.1×1012= OPU/ml
    5.8.2 空斑測定法
    空斑法測定滴度的主要原理是病毒感染QBI-293A細胞后,通過(guò)一個(gè)感染周期便可再感染鄰近細胞,直至形成一個(gè)成熟的空斑。這是所有生物學(xué)方法測定病毒滴度中最具挑戰性的方法。由于許多因素如單層細胞質(zhì)量、操作和觀(guān)察方法等都可影響到最后的結果,因此這一方法得到的結果往往最不穩定。
    1. 5×105細胞/60mm培養皿用5ml DMEM5%培養,3-4小時(shí)后等細胞貼壁即可進(jìn)行病毒感染;蛘咴诓《靖腥厩耙惶旒尤3×105細胞/60mm培養皿
    。
    2. 在12孔板中稀釋病毒,儲存于-20℃或-80℃備用。第1個(gè)稀釋孔將病毒保存液稀釋至1ml,其它孔稀釋至3ml,大體積可提高可重復性。稀釋濃度原則視病毒濃度而定(純化還是未純化的),調節稀釋度至10-100個(gè)病毒/孔,一般為10-12,這樣稀釋比大約為10-7~10-12。
    稀釋?zhuān)簩?00ul病毒保存液加入900ul DMEM5%。用移液器上下吸打5次,此時(shí)稀釋度為10-1。換用新槍頭將300ul 10-1稀釋液加入2.7ml DMEM5%吸打5次,稀釋度為10-2。然后分別取300ul前一稀釋液加入2.7ml DMEM5%,形成一系列稀釋度,最后4個(gè)稀釋度用于感染細胞。
    注意:每次稀釋時(shí)都必須換用新槍頭。
    3. 吸去細胞培養液,每個(gè)培養皿中加入1ml病毒稀釋液和1ml DMEM5%,十字形輕輕晃動(dòng)混勻,37℃培養90分鐘。
    4. 吸去培養液,按5.2.2中所述加入1.25%瓊脂糖培養基。
    5. 37℃培養,經(jīng)常注意是否有空斑形成和是否需要加入新鮮培養基。21天后應該可以看到空斑形成的白色小斑點(diǎn)。
    結果:計數有多少個(gè)獨立的空斑形成,將此數目乘以稀釋度即可得到每毫升產(chǎn)生的空斑形成單位(PFU/ml)。
    5.8.3 50%組織培養感染劑量法
    此方法基于最高稀釋度下在QBI-293A細胞中CPE的形成,它是昆騰公司用于測定滴度的標準方法。
    5.8.3.1 細胞準備:
    1. 收集一瓶QBI-293A細胞,計數。
    2. 用DMEM 2%準備20ml 105/ml細胞。
    3. 用12道排槍在2塊96孔板中每孔加入100ul細胞懸液。
    5.8.3.2 準備稀釋病毒液
    1. 第1管中加入0.9ml DMEM 2%,其余加入1.8ml。第1管中再加入0.1ml病毒保存液。
    2. 上下吸打5次混勻。
    3. 換用新槍頭。
    4. 從第1管中吸取0.2ml加入第2管中。
    5. 反復稀釋至最高稀釋度。
    6. 用同一管病毒保存液進(jìn)行第2輪稀釋。
    7. 最后8個(gè)稀釋液加入96孔板,每孔0.1ml,每個(gè)稀釋度10孔,2孔為陰性對照。陰性對照孔中加入0.1ml DMEM 2%監測細胞存活情況。加樣時(shí)從最高稀釋度開(kāi)始。
    8. 37℃培養10天。
    9. 10天后倒置顯微鏡下觀(guān)察,計算每一排中出現CPE的孔數。只要有一小點(diǎn)或是一些細胞出現CPE即為陽(yáng)性,如果無(wú)法確定,可與陰性對照比較。
    10. 計算每一排中出現陽(yáng)性的孔數。
    如果陰性對照中無(wú)任何CPE且細胞生長(cháng)良好,最低稀釋度100%陽(yáng)性而最高稀釋度100%
    陰性,則本測試即為有效。
    圖7:TCID50的典型結果 
    稀釋度孔對 照
    稀釋度 比率 3v q- /  2 
    10-10 0/10=0 uc% ?\0jo# 
    10-9 0/10=0 F78?54dN]2 
    10-8 2/10=0.2 ' 7]<Qo ¬g 
    10-7 6/10=0.6 HG1gai 7Z# 
    10-6 10/10=1 |_?1%0rv> 
    10-5 10/10=1 oQ =  | d, 
    10-4 10/10=1 iE  +F ' 5 
    10-3 10/10=1 D 8| *gu&o 
    在這一例子中,當稀釋度為10-6時(shí)出現100%陽(yáng)性,當稀釋為10-9時(shí)出現0%陽(yáng)性。因此,滴度可以用KARBER統計法精確算出:對于100ul的稀釋液,滴度為T(mén)=101+d(s-0.5)
    d=log10稀釋度=1(對于10倍的稀釋度而言)
    s=陽(yáng)性比率之和(從第1個(gè)10倍稀釋度開(kāi)始)=1+1+1+1+1+1+0.6+0.2+0+0=6.8。
    雖然一些低稀釋度在測定中省略了(如10-1和10-2),但在計算時(shí)仍應以陽(yáng)性比率為1來(lái)算。
    滴度:T=101+1(6.8-0.5)=107.3(100ul病毒保存液中)
    T=100.3≈2×108 TCID50/ml。 
    說(shuō)明:我們已經(jīng)證實(shí),TCID50法測到的滴度d=log10值比標準空斑法高0.7。
    將TCID50/ml轉換為PFU/ml:
    T=1×108.3 TCID50/ml=1×108.3-0.7 PFU/ml=1×107.6 PFU/ml≈4×107 PFU/ml。
    兩次重復試驗得到的滴度值應相差≤0.7個(gè)log10值(100.7)。

     

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