(1)核衣殼蛋白A.核衣殼結構蛋白(NP)副粘病毒屬的核衣殼結構蛋白是核衣殼蛋白(N)的主要成分，其結構單位有兩個(gè)主要區域。一是氨基端區域，約占整個(gè)結構單位的三分之二，它與RNA直接結合；另一個(gè)是羧基端區域，裸露于裝配后的核衣殼表面，胰蛋白酶處理后可以由核衣殼上解離下來(lái)，表明在兩區域的結合部位存在有對蛋白酶敏感的結合點(diǎn)。如上所述，在感染負鏈RNA病毒的細胞中，僅是那些沒(méi)有被核衣殼蛋白包裹的病毒RNA具有病毒mRNA作用。另外，無(wú)核衣殼的RNA，在無(wú)細胞系統中是RNA合成的模板。這些結果說(shuō)明，核衣殼結構單位與負鏈RNA病毒基因組模板活性有著(zhù)密切的關(guān)系。然而副粘病毒的核衣殼蛋白中的NP和N蛋白必須與操縱RNA合成的輔助蛋白相互作用，才能完成RNA的合成。特異性抗輔助蛋白結構單位的抗體對RNA合成的抑制,也充分證明了這一點(diǎn)。B.輔助核衣殼蛋白是與RNA復制和轉錄酶促反應過(guò)程相關(guān)的主要輔助性蛋白質(zhì)，包括L蛋白和較小的P蛋白，這些輔助蛋白的作用是相互協(xié)同才能發(fā)揮作用。也就是說(shuō)，當單一的某蛋白質(zhì)加入到核衣殼RNA模板時(shí)，不具有催化RNA合成的能力。在RNA復制過(guò)程中輔助核衣殼蛋白的作用是在每一病毒基因的3’末端加上多聚(A)和在5’末端的轉錄后的修飾。研究表明，L蛋白起很重要的作用，致于P蛋白的功能尚不十分明確。
(2)囊膜糖蛋白A.附著(zhù)蛋白所有的副粘病毒都具有一個(gè)表面糖蛋白，它介導病毒與細胞的附著(zhù)。在副粘病毒屬和麻疹病毒屬，這些糖蛋白與細胞的含唾液酸的受體結合，其親和性很高，具有血凝素和神經(jīng)氨酸酶活性，因而稱(chēng)為HN(hemagglutinin－neuraminidase)。在沒(méi)有神經(jīng)氨酸酶活性的病毒屬中，如麻疹病毒屬，則稱(chēng)為H。在肺病毒屬中同源的附著(zhù)蛋白無(wú)血凝素和神經(jīng)氨酸酶活性，因而被稱(chēng)為G蛋白。H和HN蛋白其氨基端具有很強的疏水性，這一區域使其固定在病毒囊膜的雙層脂質(zhì)膜內，雖然副粘病毒屬的HN蛋白的三維結構還沒(méi)有確證，但可以肯定其結構和功能是相關(guān)的。業(yè)已明確，許多副粘病毒RNA編碼的附著(zhù)蛋白的核苷酸序列。由序列分析推斷的氨基酸序列可知，HN和H蛋白約含600個(gè)氨基酸。就HN蛋白而言，大約在距每一分子的氨基端200個(gè)氨基酸處的6個(gè)氨基酸是非常保守的，基于與流感病毒神經(jīng)氨酸酶活性位點(diǎn)的比較，間接說(shuō)明這一保守區與神經(jīng)氨酸酶活性有關(guān)。另一個(gè)距氨基端約400個(gè)氨基酸的區域，與流感病毒血凝素的唾液酸結合位點(diǎn)具有部分同源性，表明部分HN附著(zhù)位點(diǎn)的存在。在研究仙臺病毒溫度敏感變異株的條件性吸附缺陷時(shí)，在羧基端區域也發(fā)現有HN結合位點(diǎn)的部分序列，說(shuō)明活性位點(diǎn)在氨基酸一級結構中分開(kāi)，在折疊分子中結合才能發(fā)揮作用。人呼吸道合胞體病毒的附著(zhù)蛋白G的編碼基因，由298個(gè)氨基酸組成。B.融合蛋白也稱(chēng)F蛋白。副粘病毒粒子附著(zhù)于宿主細胞后，下一步就是核衣殼釋放到胞漿內，這一過(guò)程是借助于第二種表面糖蛋白的作用，是囊膜與宿主細胞表面脂蛋白膜融合的主要因子。F蛋白的合成先以無(wú)活性的F0前體存在，由540～580個(gè)氨基酸組成，前體F0由蛋白酶水解后才發(fā)揮其融合作用。水解位點(diǎn)位于距F0蛋白氨基端大約100個(gè)氨基酸處，并且有兩個(gè)特點(diǎn)：位點(diǎn)的氨基端存在一個(gè)由賴(lài)氨酸和精氨酸組成的短序列；在羧基端存在有約為30個(gè)氨基酸的疏水性長(cháng)序列。不同種屬的副粘病毒，甚至同種內的不同毒株，在F0蛋白水解位點(diǎn)的氨基端的精、賴(lài)氨酸的數量和距離都各不相同，兩氨基酸成對則標志著(zhù)易于水解，致病性增強。水解后，形成一個(gè)較大的疏水亞單位F1，具有嵌入宿主細胞膜的融合機能。水解后較小的約100個(gè)氨基酸的產(chǎn)物稱(chēng)為F2。兩個(gè)亞單位均在N位點(diǎn)糖基化，進(jìn)一步增加其穩定性。C.非糖基化囊膜蛋白副粘病毒一般都具有一種相對較小的非糖基化蛋白，即膜蛋白或M蛋白，它存在于病毒囊膜的內層，被認為在病毒粒子裝配過(guò)程中參與囊膜形成，介導核衣殼與囊膜之間的識別，以維持病毒粒子結構的完整性。D.其它囊膜蛋白呼吸道合胞體病毒22K基因編碼一個(gè)小的蛋白質(zhì)，參與囊膜形成，但其具體功能尚不清楚。犬副流感病毒2型和腮腺炎病毒，在F和HN基因之間有一小基因，編碼一小疏水性蛋白質(zhì)，稱(chēng)為SH蛋白(smallhydrophobicprotein)，盡管其功能不詳，但由于其具有疏水性，表明對雙層脂膜有親和性。(3)非結構蛋白質(zhì)有一個(gè)或多個(gè)功能尚不清楚的小蛋白質(zhì)，編碼于副粘病毒屬病毒基因組中，一般以文字數字命名，這些小蛋白質(zhì)在不同病毒中其編碼方式不盡相同。
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