斯坦尼等人在1962年提出原核生物的概念,表明細菌是一群與其他生物有明顯界限而又有關(guān)聯(lián)的單細胞生物。1981年由斯坦尼等主編的第1版《原核生物》,對原核生物界的全面認識起到了重要作用。
1991年由伯隆斯等主編的第2版《原核生物》,完全遵照原核生物系統發(fā)育的順序描述了每個(gè)分支上細菌的屬或更高的分類(lèi)單元。這個(gè)原核生物系統發(fā)育是以伍斯的核糖體RNA序列同源性為基礎,首次為單細胞的原核生物建立了真正的系統發(fā)育樹(shù)。
第2版《原核生物》在主題編排上與第1版有本質(zhì)的不同。第2版完全按照系統發(fā)育樹(shù)進(jìn)行了各章節的編排。當然這也存在某些問(wèn)題,一是一些表觀(guān)特征相近而系統發(fā)育上無(wú)關(guān)的菌群將在不同章節中描述;二是一些系統發(fā)育不確定的菌群無(wú)法歸屬。為了解決這些矛盾,第2版將所有內容分為6部分:
a、引言:介紹微生物學(xué)的廣泛性、原核生物的多樣性、系統發(fā)育、分離鑒定、保藏及應用。
b、包括如下章節:原核生物的生命周期、習性、厭氧生長(cháng)、相互作用,并在一系列概要性的章節中介紹了人們所熟悉的表觀(guān)特征群。
c、按照系統發(fā)育學(xué),介紹古生菌有關(guān)的目和屬。
d、按照系統發(fā)育學(xué),介紹細菌域中的各個(gè)分支,這部分是《原核生物》的主要內容。
e、包括那些 已建立了固定的共生作用的微生物。
f、包括還未確定系統發(fā)育關(guān)系的菌群。
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