環(huán)境監測是了解環(huán)境狀況和科學(xué)治理環(huán)境的重要手段，它包括化學(xué)分析、物理測定和生物監測3個(gè)部分。生物監測是利用生物對環(huán)境污染所發(fā)出的各種信息來(lái)判斷環(huán)境污染狀況。在生物監測中，微生物監測是重要的組成部分。因為生態(tài)環(huán)境中的微生物是環(huán)境污染的直接承受者，環(huán)境狀況的任何變化都對微生物群落結構和生態(tài)功能產(chǎn)生影響，因此用微生物作為環(huán)境監測的指標之一是非常靈敏和真實(shí)可靠的。
（一）以含菌量作為檢測環(huán)境質(zhì)量的指標
1、水的衛生指標
水體中如存在某種腸道細菌即表明該水體曾被糞便污染，并有可能存在病原微生物。一般情況下，水中的致病微生物總量總是較少，而且直接檢測也很困難。因此在水質(zhì)衛生學(xué)檢查中，通過(guò)檢測與病原微生物并存于腸道且容易檢出的腸道細菌作為指標菌，以取代對病原微生物 的直接檢測。 目前在水質(zhì)細菌衛生學(xué)檢測中，大腸菌群、糞鏈球菌和產(chǎn)氣莢膜梭菌常用作水質(zhì)污染糞便的指標菌，其中以大腸菌群最為常用。因為大腸菌群在糞便中數量較多，且存活時(shí)間與腸道病原微生物大致相同，而檢驗方法又容易操作。
大腸菌群中如以典型大腸桿菌為主，說(shuō)明水質(zhì)受到糞便近期污染；如以非典型大腸桿菌為主，則表明水質(zhì)受到陳舊糞便的污染。
為排除土壤中原存大腸菌群的干擾，通常將溫度從37升至44檢測，這時(shí)檢測出來(lái)的大腸菌群稱(chēng)為“糞大腸菌群”，而在30攝氏度檢測出來(lái)的大腸菌群稱(chēng)為“總大腸菌群”。
在水質(zhì)衛生學(xué)檢測中，根據水中大腸菌群的多少判定水質(zhì)污染程度和飲用水的安全性。在實(shí)際中，常用“大腸菌群指數”和“大腸菌群值 ”作為指標。大腸菌群指數是指每100ml水中所含的大腸菌群的數量，而大腸菌群值則是驗出一個(gè)大腸菌群的最少水樣量（ml）。兩者的關(guān)系可用下式表示：
大腸菌群值=100/大腸菌群指數
2、空氣的污染程度
空氣中的微生物主要來(lái)自人類(lèi)的生活和生產(chǎn)活動(dòng)。它們附著(zhù)于固體塵�；蛞后w水滴上，隨載體懸浮于空氣中。微生物污染空氣，容易造成呼吸道疾病的流行。因此要對空氣中的微生物進(jìn)行檢測，以判斷空氣的污染程度。 目前直接檢測空氣中的病原微生物尚有困難，主要是通過(guò)檢測空氣中的菌落總數作為指標來(lái)評價(jià)空氣質(zhì)量�？諝庵械木淇倲党Ｓ米矒舴ê推矫娉两捣▉�(lái)檢測。
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